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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Transcriptional signatures underlying dynamic phenotypic switching and novel disease biomarkers in a linear cellular model of melanoma progression

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Autor(es):
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Pessoa, Diogo de Oliveira [1] ; Rius, Flavia Eichemberger [2] ; Angelo Papaiz, Debora D. [2] ; Pedroso Ayub, Ana Luisa [2] ; Morais, Alice Santana [2] ; de Souza, Camila Ferreira [2] ; da Paixao, Vinicius Ferreira [1] ; Setubal, Joao Carlos [1] ; Newton-Bishop, Julia [3] ; Nsengimana, Jeremie [3, 4] ; Azevedo, Hatylas [5] ; Reis, Eduardo Moraes [1] ; Jasiulionis, Miriam Galvonas [2]
Número total de Autores: 13
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Sao Paulo, Dept Bioquim, Inst Quim, Sao Paulo - Brazil
[2] Univ Fed Sao Paulo, Pharmacol Dept, Sao Paulo - Brazil
[3] Univ Leeds, Inst Med Res St Jamess, Leeds, W Yorkshire - England
[4] Newcastle Univ, Populat Hlth Sci Inst, Biostat Res Grp, Newcastle, NSW - Australia
[5] Univ Fed Sao Paulo, Dept Surg, Div Urol, Sao Paulo - Brazil
Número total de Afiliações: 5
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: Neoplasia; v. 23, n. 4, p. 439-455, APR 2021.
Citações Web of Science: 0
Resumo

Despite advances in therapeutics, the progression of melanoma to metastasis still confers a poor outcome to patients. Nevertheless, there is a scarcity of biological models to understand cellular and molecular changes taking place along disease progression. Here, we characterized the transcriptome profiles of a multi-stage murine model of melanoma progression comprising a nontumorigenic melanocyte lineage (melan-a), premalignant melanocytes (4C), nonmetastatic (4C11-) and metastasis-prone (4C11 +) melanoma cells. Clustering analyses have grouped the 4 cell lines according to their differentiated (melan-a and 4C11 +) or undifferentiated/{''}mesenchymal-like{''} (4C and 4C11-) morphologies, suggesting dynamic gene expression patterns associated with the transition between these phenotypes. The cell plasticity observed in the murine melanoma progression model was corroborated by molecular markers described during stepwise human melanoma differentiation, as the differentiated cell lines in our model exhibit upregulation of transitory and melanocytic markers, whereas ``mesenchymal-like{''} cells show increased expression of undifferentiated and neural crest-like markers. Sets of differentially expressed genes (DEGs) were detected at each transition step of tumor progression, and transcriptional signatures related to malignancy, metastasis and epithelial-to-mesenchymal transition were identified. Finally, DEGs were mapped to their human orthologs and evaluated in uni-and multivariate survival analyses using gene expression and clinical data of 703 drug-naive primary melanoma patients, revealing several independent candidate prognostic markers. Altogether, these results provide novel insights into the molecular mechanisms underlying the phenotypic switch taking place during melanoma progression, reveal potential drug targets and prognostic biomarkers, and corroborate the translational relevance of this unique sequential model of melanoma progression. (AU)

Processo FAPESP: 17/25321-5 - A função de lncRNA na progressão do melanoma
Beneficiário:Ana Luisa Pedroso Ayub
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 19/05641-0 - Papel de lncRNAs e de redes regulatórias envolvendo lncRNAs, miRNAs e mRNAs na progressão do Melanoma
Beneficiário:Ana Luisa Pedroso Ayub
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Processo FAPESP: 09/51462-9 - Assinaturas moleculares da progressao do melanoma.
Beneficiário:Camila Ferreira de Souza
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 18/20775-0 - RNAs não codificantes envolvidos com a gênese e a progressão do melanoma
Beneficiário:Miriam Galvonas Jasiulionis
Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
Processo FAPESP: 14/01168-5 - Identificação de importantes alvos associados com o estado stem-like e a transição epitélio-mesênquima ao longo da transformação maligna de melanócitos
Beneficiário:Alice Santana Morais
Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Processo FAPESP: 11/18959-7 - Investigação nas fases iniciais da gênese do melanoma de reguladores chaves da transição epitélio-mesênquima e do fenótipo stem cell-like controlados epigeneticamente
Beneficiário:Alice Santana Morais
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 14/13663-0 - Integração de dados de expressão de genes e microRNAs, metiloma e hidroximetiloma de diferentes etapas da progressão do melanoma.
Beneficiário:Miriam Galvonas Jasiulionis
Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular