Acidobacteria Subgroups and Their Metabolic Potent... - BV FAPESP
Busca avançada
Ano de início
Entree
(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Acidobacteria Subgroups and Their Metabolic Potential for Carbon Degradation in Sugarcane Soil Amended With Vinasse and Nitrogen Fertilizers

Texto completo
Autor(es):
de Chaves, Miriam Goncalves [1] ; Silva, Genivaldo Gueiros Z. [2] ; Rossetto, Raffaella [3] ; Edwards, Robert Alan [2] ; Tsai, Siu Mui [1] ; Navarrete, Acacio Aparecido [4, 1]
Número total de Autores: 6
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Sao Paulo, Cell & Mol Biol Lab, Ctr Nucl Energy Agr, Piracicaba - Brazil
[2] San Diego State Univ, Computat Sci Res Ctr, San Diego, CA 92182 - USA
[3] Sao Paulos Agcy Agribusiness Technol APTA SAA, Piracicaba - Brazil
[4] Univ Fed Sao Carlos, Dept Environm Sci, Sorocaba - Brazil
Número total de Afiliações: 4
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: FRONTIERS IN MICROBIOLOGY; v. 10, JUL 30 2019.
Citações Web of Science: 0
Resumo

Acidobacteria is a predominant bacterial phylum in tropical agricultural soils, including sugarcane cultivated soils. The increased need for fertilizers due to the expansion of sugarcane production is a threat to the ability of the soil to maintain its potential for self-regulation in the long term, in witch carbon degradation has essential role. In this study, a culture-independent approach based on high-throughput DNA sequencing and microarray technology was used to perform taxonomic and functional profiling of the Acidobacteria community in a tropical soil under sugarcane (Saccharum spp.) that was supplemented with nitrogen (N) combined with vinasse. These analyses were conducted to identify the subgroup-level responses to chemical changes and the carbon (C) degradation potential of the different Acidobacteria subgroups. Eighteen Acidobacteria subgroups from a total of 26 phylogenetically distinct subgroups were detected based on high-throughput DNA sequencing, and 16 gene families associated with C degradation were quantified using Acidobacteria-derived DNA microarray probes. The subgroups Gp13 and Gp18 presented the most positive correlations with the gene families associated with C degradation, especially those involved in hemicellulose degradation. However, both subgroups presented low abundance in the treatment containing vinasse. In turn, the Gp4 subgroup was the most abundant in the treatment that received vinasse, but did not present positive correlations with the gene families for C degradation analyzed in this study. The metabolic potential for C degradation of the different Acidobacteria subgroups in sugarcane soil amended with N and vinasse can be driven in part through the increase in soil nutrient availability, especially calcium (Ca), magnesium (Mg), potassium (K), aluminum (Al), boron (B) and zinc (Zn). This soil management practice reduces the abundance of Acidobacteria subgroups, including those potentially involved with C degradation in this agricultural soil. (AU)

Processo FAPESP: 11/51749-6 - Bioindicadores funcionais para monitoramento da qualidade do solo para o manejo sustentável da produção de biomassa em cana-de-açúcar (BIOSQ)
Beneficiário:Tsai Siu Mui
Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Regular
Processo FAPESP: 17/03575-5 - Dinâmica da produção e consumo de metano pela microbiota ativa em áreas inundáveis da Amazônia
Beneficiário:Acacio Aparecido Navarrete
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa de Pesquisa sobre Mudanças Climáticas Globais - Jovens Pesquisadores
Processo FAPESP: 15/09436-1 - Aplicação de geochip para prospecção de genes funcionais microbianos com potencial para atuar como bioindicadores de distúrbios em solos cultivados com cana-de-açúcar sob aplicação de zinco
Beneficiário:Acacio Aparecido Navarrete
Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 12/13321-7 - Bio-indicadores microbianos taxonômicos e funcionais em solos sob sistemas de produção de cana-de-açúcar
Beneficiário:Acacio Aparecido Navarrete
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 14/06077-8 - Anotação metagenômica e análise de bioinformática aplicada à definição de bioindicadores microbianos para os efeitos do manejo agrícola do solo em sistemas de produção de cana-de-açúcar
Beneficiário:Acacio Aparecido Navarrete
Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado