Bryan Etindi Abuchery

Biólogo molecular e entusiasta da Bioinformática com Mestrado em Genética e Bacharelado em Microbiologia. Logo após minha graduação, consegui ser admitido para uma oportunidade de estágio na Unidade de Pesquisa Médica do Exército dos Estados Unidos - Quênia. O estágio de seis meses me equipou com técnicas de Biologia Molecular que me ajudaram continuamente a obter resultados de alta qualidade em diferentes ensaios biológicos. Minha função principal no USAMRU-K envolveu uma vigilância contínua e mapeamento da leishmaniose de regiões endêmicas como Baringo, Quênia, bem como vigilância da variação genética dos patógenos causadores da leishmaniose, Leishmania major e Leishmania donovani. Outros ensaios incluíram extração de DNA / RNA (medições de concentração espectrofotométrica / fluorométrica) e PCR e eletroforese em gel (desenho de primer, PCR / RT-PCR, coloração em gel) durante o estudo de vigilância de doença febril aguda (AFI) para catalogar patógenos causadores de febre e HIV / Malaria Co-Infection Study na determinação de pacientes HIV positivos que são portadores do parasita da malária usando técnicas moleculares. Esses ensaios foram fundamentais para informar os padrões de doenças nas regiões de estudo e suas estratégias de combate. Também fui estagiário de bioinformática no centro de pesquisas do International Center for Insect Physiology (ICIPE). O hub da Unidade de Bioestatística e Bioinformática de Biologia Molecular (MBBU) alojado no ICIPE foi muito útil para me apresentar a novos conceitos de pesquisa de Biologia Molecular, como Sequenciamento de Próxima Geração e uso de ferramentas computacionais para analisar dados biológicos. Entre as principais técnicas estão a aplicação de linguagens de programação como Python e R, bioestatística e análise de dados genômicos. Como estagiário, fiz programação leve e scripts para criar fluxos de trabalho que envolvem análise de dados de material genético. Isso foi realizado por meio de várias linguagens de programação, como Bash, Python e R. No final do meu estágio no MBBU-ICIPE, - junto com meu colega de equipe, trabalhei no pipeline de análise de dados de rRNA End to End 16S com duas ferramentas de análise mais populares disponíveis hoje (QIIME2 e DADA2). O objetivo final deste projeto foi fornecer pipelines de análise para dados semelhantes gerados nos laboratórios do ICIPE em apoio ao tipo de pesquisa científica que ocorre no ICIPE. De um usuário iniciante em linguagens de programação, fico mais confortável em aspectos que envolvem a geração de dados (do wetlab) à sua análise (biologia computacional). Para revisão de código de meus projetos também, mais informações sobre meus repositórios Github podem ser encontradas aqui, enquanto uma descrição mais geral de nosso projeto de trabalho em grupo pode ser encontrada aqui. Eu também desenvolvi outras habilidades de várias outras atividades no laboratório de períodos anteriores de vinculação de alunos no Instituto de Pesquisa Médica do Quênia (KEMRI), que incluíam; Sequenciamento de DNA (sequenciamento sanger / nextgen (Sequenciamento Illumina) / análise de dados), tomada de inventário 100% e entrada de dados subsequente para contabilizar todas as amostras no banco de dados, técnicas de biologia molecular, como PCR, clonagem, engenharia molecular e ELISA, culturas celulares ( Cultura e sensibilidade de amostras microbiológicas) e testes bioquímicos e RDTs contra malária, incluindo amplificação isotérmica mediada por loop (técnicas LAMP). É o amálgama dessas técnicas que me torna o Biólogo Molecular que sou hoje. Atualmente sou Aluno de Mestrado na Universidade Estadual Paulista, cursando Mestrado em Genética. Fora do laboratório, possuo grande capacidade de liderança, capaz de tomar iniciativa e gostar de jogar Ultimate Frisbee. (Fonte: Currículo Lattes)