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Construção e análise da rede integrada de interações moleculares entre genes humanos

Processo: 07/08466-8
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de abril de 2008
Vigência (Término): 31 de março de 2010
Área do conhecimento:Interdisciplinar
Pesquisador responsável:Ney Lemke
Beneficiário:Pedro Rafael Costa
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Assunto(s):Sistemas complexos   Biologia computacional   Redes biológicas
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:genes humanos | Redes Biológicas | Sistemas Complexos | Bioinformática

Resumo

O método reducionista tem ajudado no esclarecimento do funcionamento de muitos processos biológicos. Porém, tais processos são extremamente complexos e possuem propriedades emergentes que não podem ser explicadas ou mesmo previstas através do reducionismo. Para suplantar esses limites, pesquisadores têm usado um conjunto de métodos conhecido como biologia de sistemas, nova área da biologia cujo objetivo é a compreensão das interações não-lineares entre os múltiplos componentes dos processos biológicos. Essas interações podem ser representadas por um objeto matemático chamado grafo ou rede, onde os elementos interagentes são representados por nodos e as interações por arcos que conectam pares de nodos. Neste projeto, nós propomos a construção e a análise topológica da rede integrada de interações moleculares entre genes humanos contendo interações físicas entre proteínas, interações metabólicas, interações de regulação transcricional e interações de regulação por microRNAs.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
COSTA‚ P.R.; ACENCIO‚ M.L.; LEMKE‚ N.. A machine learning approach for genome-wide prediction of morbid and druggable human genes based on systems-level data. BMC Genomics, v. 11, n. Suppl 5, p. S9, . (07/02827-9, 07/01213-7, 07/08466-8)

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