Análise genômica completa de cepas de HuRV-A de São Paulo,Brasil, genotipos G2 e G não-tipável: utilização do novo sistema de classificação e investigação de variabilidade genotípica após introdução da vacina no sistema brasileiro de saúde pública.

Resumo

A gastroenterite é uma das doenças mais frequentes em humanos e os rotavírus são considerados seu principal agente etiológico. Membros da família Reoviridae, gênero Rotavirus, possuem genoma de 11 segmentos de dsRNA, que codificam, cada um, para pelo menos uma proteína (seis proteínas estruturais - VP - e seis não-estruturais - NSP). Os rotavírus do grupo A, são classificados em genotipos/sorotipos de acordo com a especificidade antigênica de duas proteínas do capsídeo externo: VP7 (G) e VP4 (P). Estudos de epidemiologia molecular apontam para uma enorme variedade de genotipos infectando humanos no mundo. Isso se deve, principalmente, à ocorrência de reassortments entre os segmentos de RNA e, por isso, um novo sistema de classificação foi proposto em 2008, baseado no sequenciamento de nucleotídeos (nt) desses segmentos. O presente trabalho pretende sequenciar, classificar e analisar filogeneticamente as sequências de nt das ORFs dos 11 segmentos de RNA de 113 cepas de rotavírus coletadas no estado de São Paulo, para se investigar a ocorrência de transmissões interespecíficas e reassortments, a origem evolutiva das cepas e a existência de novos genotipos. Pretende-se analisar a variabilidade de genotipos em cepas G2, que vem emergindo na população brasileira, após a introdução da vacina em 2006. Esses dados serão comparados a dados que vem sendo divulgados pelo mundo, utilizando-se esse novo sistema de classificação, e contribuirão para um melhor entendimento dos rotavírus circulantes na região. Também poderão fornecer informações a respeito da possibilidade de diferentes genotipos emergirem na população, em decorrência da introdução de vacinas monovalentes.