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Simulações de dinâmica molecular dos receptores do hormônio tireoideano

Processo: 06/06831-8
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de abril de 2007
Vigência (Término): 30 de junho de 2010
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química
Pesquisador responsável:Munir Salomao Skaf
Beneficiário:Leandro Martinez
Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Simulação de dinâmica molecular   Química teórica
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Dinamica Molecular | Hormonio Tireoidano | Química Teórica

Resumo

Os receptores nucleares são uma importante família de proteínas responsável pelo controle da transcrição de vários genes. São proteínas que se ligam ao DNA, e a associação de hormônios (Estrógeno, Hormônio Tireoideano, Vitamina A, entre outros) define se um determinado gene deve ser transcrito. Em 1995 as primeiras estruturas dos domínios destas proteínas responsáveis pela ligação dos hormônios foram obtidas. Isto permitiu um grande salto na compreensão da biologia molecular do reconhecimento hormonal. No entanto, apesar de que novas estruturas foram obtidas para diferentes receptores, o papel da dinâmica dos receptores em sua atividade permaneceu fundamentalmente desconhecido. Durante minha pós-graduação, estudei várias aspectos relacionados à dinâmica dos receptores nucleares e seu papel na função biológica destas proteínas. Obtivemos resultados que associam a dinâmica dos receptores à sua função para vários problemas diferentes, como a associação e a dissociação dos ligantes, as razões da seletividade destes ligantes e os mecanismos de desnaturação dos receptores, por exemplo. A complementação de alguns destes trabalhos usando novas técnicas que desenvolvemos deve complementar os estudos realizados durante minha tese de doutorado. A realização destes trabalhos nestas novas frentes deve levar à consolidação do conjunto de estudos realizados durante meu doutorado como um estudo bastante abrangente sobre a dinâmica de receptores nucleares. As três principais propostas de pesquisa que pretendemos realizar são:1. Estudar o mecanismo de entrada dos ligantes nos receptores. 2. Identificar os estados de transição do processo de desenovelamento dos receptores. 3. Obter caminhos ótimos de dissociação.

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
LIBERATO, MARCELO VIZONA; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; AYERS, STEVEN D.; LIN, JEAN Z.; CVORO, ALEKSANDRA; SILVEIRA, RODRIGO L.; MARTINEZ, LEANDRO; SOUZA, PAULO C. T.; SAIDEMBERG, DANIEL; DENG, TUO; et al. Medium Chain Fatty Acids Are Selective Peroxisome Proliferator Activated Receptor (PPAR) gamma Activators and Pan-PPAR Partial Agonists. PLoS One, v. 7, n. 5, . (06/06831-8, 06/00182-8, 04/08070-9)
MARTINEZ, LEANDRO; POLIKARPOV, IGOR; SKAF, MUNIR S.. Only subtle protein conformational adaptations are required for ligand binding to thyroid hormone receptors: Simulations using a novel multipoint steered molecular dynamics approach. Journal of Physical Chemistry B, v. 112, n. 34, p. 10741-10751, . (06/06831-8, 06/00182-8)
MARTINEZ, LEANDRO; SOUZA, PAULO C. T.; GARCIA, WANIUS; BATISTA, FERNANDA A. H.; PORTUGAL, RODRIGO V.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; NAKAHIRA, MARCEL; LIMA, LUIS M. T. R.; POLIKARPOV, IGOR; SKAF, MUNIR S.. On the Denaturation Mechanisms of the Ligand Binding Domain of Thyroid Hormone Receptors. Journal of Physical Chemistry B, v. 114, n. 3, p. 1529-1540, . (06/06831-8, 06/00182-8)
DE ARAUJO, ALEXANDRE SUMAN; MARTINEZ, LEANDRO; NICOLUCI, RICARDO DE PAULA; SKAF, MUNIR S.; POLIKARPOV, IGOR. Structural modeling of high-affinity thyroid receptor-ligand complexes. EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS, v. 39, n. 11, p. 1523-1536, . (06/01977-4, 06/06831-8, 06/00182-8)

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