ncRNAs:investigando funções e biogênese

Resumo

Além de sua relevância médica, os parasitas Leishmania são excelentes modelos para estudar processos genéticos e bioquímicos. As peculiaridades de sua organização genética são notáveis; seus genes são organizados em longos conjuntos de clusters direcionais, policístrons estruturais e funcionais. Não há promotores canônicos para controlar a transcrição da RNA polimerase II de genes codificadores de proteínas, que são desprovidos de íntrons. Portanto, uma diversidade de fatores e processos regulatórios pós-transcricionais são centrais para a regulação da expressão gênica neste organismo. Em outros organismos, aos RNAs não codificadores (ncRNAs) foram atribuídas funções diversas e essenciais em diferentes níveis da regulação da expressão gênica; da transcrição ao processamento e aos controles de estabilidade e taxa de tradução de mRNAs. Nas últimas décadas, os chamados RNAs regulatórios, ainda de classificação imprecisa, têm recebido funções tão diversas quanto o sequestro de proteínas para formar complexos lncRNA-proteína específicos, a atuação como sinalizadores, intensificadores, guias, entre outros (Statello et al., 2021, Gil & Ulitsky, 2020, Mercer et al., 2009, Quinn & Chang, 2016). Diferentes classes de ncRNA regulatórios já foram descritas em tripanossomatídeos (Michaeli et al., 2012, Kolev et al, 2019, Rajan et al, 2020). Em relação às funções e características dos ncRNAs em Leishmania, estamos apenas tocando na superfície; seus papéis biológicos e seu envolvimento na aptidão do parasita, permitindo a sobrevivência em ambos os ambientes hostis, devem ser investigados. Entre os onze mil ncRNAs putativos que identificamos em L. braziliensis, cerca de três mil são expressos diferencialmente (Ruy et al, 2019). Buscamos análise funcional e coletamos resultados preliminares para um pequeno grupo deles. A seleção incluiu inspeção manual do locus para confirmar um bom nível de expressão diferencial, apresentando preferencialmente níveis mais altos em estágios infecciosos, características e perfil de expressão anotados por vizinhos e força de predição do transcrito como um ncRNA.Investigaremos funcionalmente ncRNAs longos diferencialmente expressos (DE lncRNAs) e, paralelamente, investigar sua biogênese.O objetivo deste projeto de pós-doutorado é contribuir com os estudos funcionais sobre ncRNAs, incluindo (i) investigar a função de diferentes categorias de ncRNAs longos (de regiões intergênicas e 3'UTR de mRNAs) e (ii) investigar a biogênese dos ncRNAs estudados.