Modelagem de bancos de dados e adequação de analises em bioinformática de processos de regulação de expressão e variabilidade genômica em Leishmania.

Resumo

O estudo envolve a integração de dados em larga escala da expressão gênica e variabilidade genética em diferentes níveis, juntamente com a análise fenotípica de mutantes do parasito. As análises incluem a definição de diferentes transcriptomas, genomas e epigenomas, além da identificação de complexos proteína:RNA nosdiferentes mutantes gerados. Para garantir que os dados gerados sejam armazenados corretamente e possam ser facilmente acessados e integrados, é essencial desenvolver e utilizar ferramentas computacionaisapropriadas. Essas ferramentas podem ajudar a processar os dados brutos, realizar análises estatísticas, visualizar os resultados e armazenar as informações de forma organizada. A escolha das ferramentas específicas dependerá das necessidades do estudo. Além disso, a documentação adequada e a adoção de boas práticas de gerenciamento de dados facilitarão o resgate e a integração dos dados gerados.Os objetivos são:1) Análise em larga escala do perfil epigenético da resposta a estresse do processo de replicação do DNA.2) Análise de variação de número de cópias e alterações na organização do genoma em células submetidas a estresse replicativo e/ou depletadas para fatores da resposta a danos no DNA.3) Desenvolvimento e integração de ferramentas computacionais adequadas para a prospecção de dados sobre as linhagens de Leishmania nocaute para diferentes ncRNAs ou genes codificadores.4) Desenvolvimento de ferramentas computacionais de análise de interações entre ncRNAs e proteínas,ncRNAs e mRNA ou ncRNAs e DNA.5) Organização e manutenção de bancos de dados para armazenar resultados obtidos em estratégias de análise em larga escala, possibilitando a busca, integração e representação dos dados.