Identificação de genes relacionados a diferenças de perfis de ácidos graxos no músculo esquelético entre bovinos Nelore desmamados de forma convencional e precoce no norte do Pantanal.

Resumo

Devido a grande importância da raça Nelore na pecuária de corte brasileira, pesquisas envolvendo melhoramento e visando uma melhora na qualidade de carne têm sido cada vez mais desenvolvidas no país. O desmame precoce tem se mostrado, dentre outros manejos nutricionais, uma técnica de seleção genética, tendo em vista que permite diminuição do período entre partos, além de, pela possibilidade de serem desmamados precocemente e suplementados com dietas concentradas durante a fase de cria, uma fase de extrema importância no desenvolvimento do animal, pode levar a mudanças consideráveis no metabolismo, que estão intrinsecamente conectados aos parâmetros determinantes de qualidade de carne. Logo, este trabalho tem como objetivo avaliar alterações metabólicas do tecido muscular de bezerros Nelore submetidos a diferentes protocolos de desmama a partir da abundância diferencial de ácidos graxos e da relação destes com dados de expressão genica muscular diferencial. Para isso, foram utilizados no total 40 animais separados em 2 tratamentos, 20 submetidos ao desmame convencional (DC) e 20 submetidos ao desmame precoce (DP) e posteriormente suplementados a pasto até o abate. Para essas análises, oito amostras de carnes de cada tratamento foram aleatoriamente selecionadas e submetidas ao protocolo de extração de lipídeos conhecido como Bligh & Dyer e para obtenção de perfis de ácidos graxos das amostras será utilizado o método "Multiple-reaction monitoring" ou MRM. A filtragem de AG válidos será realizada utilizando o programa R, em que serão avaliadas as abundâncias relativas médias entre AGs identificados e os controles negativos. Todo AG com valores menores que zero serão eliminados. A partir disso, utilizando a ferramenta MetaboAnalyst 6.0 (Zhiqiang P. Et al 2024), AGs observado em menos do que 50% das amostras dentro de um grupo serão eliminados e outliers serão excluídos com base no IQR. Para determinar AG diferencialmente abundantes entre tratamentos, será aplicado o teste t de student para amostras não pareadas em que serão comparadas as médias de cada AG entre os grupos experimentais e as que apresentarem valores de p < 0,05 serão considerados significativos. Os dados de expressão foram obtidos por RNA-Seq seguido por controle de qualidade e alinhamento ao genoma bovino ARS-UCD1.2, para análise integrada dessas amostras, será utilizado o algoritmo DIABLO do pacote do R, mixOmics e para uma análise de enriquecimento de grupos lipídicos será utilizado de um banco de dados de ontologia (LION - Lipid Ontology), portanto, ambos resultados de enriquecimento funcional lipídico e gênico serão analisados de forma conjunta. Espera-se que, nos animais submetidos a DP e suplementados com dieta concentrada, haja uma maior expressão de genes relacionados à produção de ácidos graxos, em relação aos animais submetidos a desmama convencional.