Estudo transcriptômico de modelo de zebrafish para investigar mecanismos fisiopatológicos da síndrome de xia-gibbs

Resumo

A síndrome de Xia-Gibbs (SXG, OMIM #615829) é um transtorno de neurodesenvolvimento causado por variantes patogênicas em heterozigose no gene AHDC1. As principais características clínicas da SGX incluem hipotonia, atraso motor e de fala e deficiência intelectual (DI). A fisiopatologia da SXG ainda não é completamente compreendida, necessitando de estudos funcionais adicionais. Desenvolvemos um modelo de zebrafish (Danio rerio) com uma mutação de perda de função em heterozigose no gene ahdc1, induzida através da técnica CRISPR-Cas9 (denominada ahdc1dsao1 - ZDB-ALT-221025-2 - em zfin.org) (CARVALHO et al. 2023). Estudos transcriptômicos são relevantes para identificação de genes diferencialmente expressos, bem como redes gênicas envolvidas, permitindo a proposição de vias biológicas alteradas em estado patológico. Assim, o presente estudo visa comparar transcriptomas de animais com três genótipos diferentes (heterozigotos, homozigotos e selvagens para mutação em ahdc1) em duas fases diferentes do desenvolvimento. Os objetivos específicos incluem a identificação de transcritos/genes com diferenças significativas entre os genótipos em cada fase, a identificação de vias biológicas enriquecidas, e a resposta a perguntas relacionadas às hipóteses do laboratório, abrangendo o envolvimento do gene ahdc1 em vias de controle de ciclo celular, mielinização, regulação de fome-saciedade, metabolismo energético, além de alterações transcricionais em genes conhecidos de distúrbios genéticos do neurodesenvolvimento. Observações relevantes serão avaliadas por RTqPCR com intuito de validação.