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Identificação de módulos de co-expressão proteica associados a células-tronco hematopoiéticas de potencial de enxertia de longa duração (LT-HSC) em populações frescas

Processo: 23/17841-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de março de 2024
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2025
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Karina Griesi Oliveira
Beneficiário:João Pedro Pereira Poit
Instituição Sede: Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein (IIEPAE). Sociedade Beneficente Israelita Brasileira Albert Einstein (SBIBAE). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:22/03118-1 - Identificação e avaliação de assinatura de expressão gênica de células-tronco hematopoiéticas por abordagens de biologia de sistemas e aprendizado de máquina, AP.PNGP.PI
Assunto(s):Aprendizado computacional   Células-tronco hematopoéticas   Proteômica   Transcriptômica   Expressão gênica
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:aprendizado de máquinas | Celulas-Tronco Hematopoieticas | proteômica | Transcriptômica | Wgcna | Expressão gênica

Resumo

Em vista da importância funcional das células-tronco hematopoiéticas de potencial de enxertia de longa duração (LT-HSC) para reconstituição medular, seja em contextos de transplantes alogênicos ou autólogos (como em aplicações recentes de terapia gênica), e de sua baixa frequência dentre as células hematopoiéticas, ainda há muitos esforços para otimizar condições de manipulação e expansão ex vivo desta população celular. A validade de marcadores de superfície de enriquecimento para LT-HSC cultivadas em diferentes condições ainda é incerta, e por isso, a demonstração da presença destas células ainda precisa ser realizada por meio de xenotransplante em camundongos a cada nova tentativa de otimização de protocolo, uma estratégia laboriosa e demorada. Assim, o delineamento de ferramentas para a avaliação prospectiva de abundância de LT-HSC cultivadas por estratégias que possam se mostrar mais robustas, comparativamente ao uso de marcadores superfície celular, e de mais simples execução, se faz extremamente importante pois pode facilitar os testes de otimização de condições de cultivo de HSC visando a manutenção de sua potencialidade. Neste sentido, é de crucial importância que se compreenda em profundidade quais são os grupos de genes que agem de forma conjunta para determinar esse fenótipo celular. A análise dessa questão no nível de proteômica e com uma abordagem sistêmica de análise trata-se de uma contribuição inédita para a literatura que pode trazer uma compreensão mais aprofundada sobre quais genes poderiam representar os marcadores ideais desta população celular.

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