Longos RNAs não codificantes no secretoma de células cancerígenas: uma análise abrangente de seu papel na atrofia muscular na caquexia associada ao câncer

Resumo

A caquexia associada ao câncer é uma síndrome debilitante caracterizada pela perda de peso e atrofia muscular, afetando profundamente a qualidade de vida e o prognóstico dos pacientes. A prevalência da caquexia entre pacientes com câncer é estimada em uma faixa de 15% a 70%, com variações dependendo do tipo específico de tumor. A síndrome compromete significativamente a resposta à radioterapia e quimioterapia, sendo caracterizada por desequilíbrios fisiológicos, metabólicos e imunológicos que afetam o metabolismo energético e o equilíbrio proteico. A caquexia associada ao câncer continua subdiagnosticada e sem tratamentos aprovados. Até o momento, não houve desenvolvimento bem-sucedido de terapias para a esta síndrome. O secretoma do microambiente tumoral (TME) desempenha um papel crucial no desenvolvimento do câncer e pode desencadear o desenvolvimento da caquexia. Várias citocinas pró-inflamatórias secretadas pelo tumor e que chegam até o músculo esquelético podem mediar a atrofia muscular. No entanto, identificar os mediadores da atrofia muscular secretados pelo tumor continua sendo um desafio pouco explorado. Os RNAs longos não codificadores (lncRNAs) são moléculas de RNA com mais de 200 nt que não codificam proteínas. Os lncRNAs desempenham um papel importante em diferentes níveis da regulação celular. No câncer, sabe-se que os lncRNAs influenciam a proliferação das células tumorais e impactam o prognóstico do paciente. Os lncRNAs têm recebido atenção significativa como candidatos promissores no diagnóstico, prognóstico e terapia do câncer, sendo examinados como alvos terapêuticos em ensaios clínicos para várias doenças. Na caquexia associada ao câncer, poucos estudos correlacionam o papel dos lncRNAs na atrofia muscular, e pouco se sabe sobre o impacto dos lncRNAs no secretoma das moléculas mediadoras da caquexia. Portanto, nosso objetivo é identificar, caracterizar e prever a função dos lncRNAs associados às vias de secreção de proteínas em vários tipos tumorais. Essa caracterização será realizada por meio da análise de dados de scRNA-seq de 12 tipos de tumores disponíveis em bancos de dados públicos, construção de redes de coexpressão de lncRNA-mRNA usando Seurat e SCENIC, e ensaios funcionais para entender o papel dos lncRNAs na atrofia muscular. Dessa forma, esperamos elucidar as vias de interação dos fatores moleculares subjacentes à caquexia associada ao câncer e explorar possíveis estratégias terapêuticas.