Proteômica estrutural para a busca de alvos terapêuticos em câncer de boca

Resumo

O tratamento para pacientes com carcinoma de células escamosas (CEC) representa um desafio clínico. Apesar dos avanços nas modalidades terapêuticas, as taxas de recorrência de CEC variam entre 18% a 76% em pacientes que recebem o tratamento padrão de cirurgia, radioterapia e/ou quimioterapia. Além disso, os pacientes com CEC apresentam uma baixa resposta a outras modalidades terapêuticas, como monoterapia contra EGFR e a imunoterapia. Em um estudo anterior (Carnielli et al., 2018), nosso grupo revelou a associação das proteínas CSTB, NDRG1 e PGK1 com o prognóstico de câncer de boca, sugerindo a hipótese de que essas proteínas podem estar envolvidas na progressão da doença. Portanto, o presente projeto propõe a aplicação de estratégias ortogonais de proteômica estrutural para a caracterização do interactoma dessas proteínas, afim de revelar os seus potenciais papeis na progressão do CEC. Para isso, a caracterização dos interactomas diferenciais dessas proteínas será realizada em queratinócitos normais (HMK) e transformados (SCC-25 e HSC3). As técnicas utilizadas para a caracterização destes interactomas serão a biotinilação dependente de proximidade e cofracionamento. Além disso, agentes de ligação cruzada serão empregados para a caracterização tridimensional das interfaces de interação. Este conjunto de métodos permitirá priorizar os complexos a serem modulados por peptídeos desenhados contra as interfaces de interação das proteínas, e os efeitos dessa modulação serão avaliados por experimentos funcionais. Por fim, a estratégia de proteólise limitada será empregada para a avaliação de alterações estruturais em complexos proteicos após o tratamento das linhagens celulares com os peptídeos, antecipando os efeitos deste tratamento no proteoma global.