Triagem molecular e de sequenciamento de última geração para infecções virais emergentes em diversas amostras clínicas

Resumo

As infecções virais emergentes apresentam grande desafio para a comunidade científica, não apenas pelo surgimento imprevisto mas também pela gravidade dos sintomas induzidos. O mundo ainda evidencia os efeitos da disseminação do patógeno SARS-CoV-2 cujo surgimento foi relacionado com altas taxas de mortalidade e morbidade. Um dos grandes desafios na ciência atual é a identificação desses vírus emergentes pois as metodologias existentes aplicam primers e sondas que não amplificam genomas desconhecidos. Portanto, a metagenômica viral é principal método que pode revelar a abundância total de vírus em amostras clínicas de várias origens. No entanto, outro relevante desafio é a confirmação molecular dos agentes encontrados nas amostras já que a classificação bioinformática não é tão precisa podendo apresentar vários artefatos e contaminações. Portanto, objetivo desse projeto é avaliar as características moleculares de diversos vírus que foram identificados através da análise metagenômica em amostras de sangue e swabs da nasofaringe. As triagens seriam feitas em duas vertentes: i) confirmação molecular do vírus emergente gemycircular SL3 em amostras de doadores de sangue de três regiões brasileiras e ii) conformação molecular dos vírus metapneumovírus, papilomavirus 5, herpesvírus 7, herpesvírus 6, vírus Epstein bar, human ortobulavirus 2, e poliomavírus em amostras de pacientes pediátricos com sintomatologia aguda porém negativos para SARS-CoV-2. O aluno também auxiliara os procedimentos de sequenciamento de última geração realizados pelo grupo.