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Diversidade de grupos de genes biossintéticos de produtos naturais em microbiomas antárcticos através de análise centrada em genomas

Processo: 22/15112-8
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Vigência (Início): 08 de maio de 2023
Vigência (Término): 07 de maio de 2024
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Valeria Maia Merzel
Beneficiário:William Bartolomeu de Medeiros
Supervisor: Nadine Ziemert
Instituição Sede: Centro Pluridisciplinar de Pesquisas Químicas, Biológicas e Agrícolas (CPQBA). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Paulínia , SP, Brasil
Local de pesquisa: Eberhard Karls Universität Tübingen, Alemanha  
Vinculado à bolsa:20/11534-0 - Diversidade e Padrões de distribuição de Genes Biossintéticos de Produtos Naturais em Microbiomas da Antártica, BP.DR
Assunto(s):Metagenômica   Genes biossintéticos   Ambientes extremos   Metabólitos secundários
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Antarctic environments | Biosynthetic genes | Metagenome mining | Secondary Metabolites | Metagenômica

Resumo

Microrganismos que habitam ambientes extremos codificam metabólitos secundários como uma estratégia de sobrevivência para prosperar em condições ambientais adversas. Tais ambientes abrigam um potencial inexplorado para a descoberta de novos compostos químicos que podem levar a novos medicamentos. Os ambientes antárticos têm sido particularmente negligenciados e o potencial biossintético das comunidades microbianas do solo da Península Antártica tem sido pouco explorado. Durante o desenvolvimento do projeto atual (FAPESP 2020/11534-0), descrevemos a diversidade de clusters de genes biossintéticos (BGCs) ao longo de gradientes espaciais e temporais no solo da Baía dos Baleeiros na Ilha Deception - Antártica usando análises baseadas em sequências. Essas descobertas lançam luz sobre o vasto potencial para a biossíntese de metabólitos secundários em comunidades microbianas do solo da Baía dos Baleeiros. No entanto, os BGCs identificados geralmente não estão completos e apenas uma fração muito pequena dos dados de short reads pode ser montada em contigs longos o suficiente para permitir a identificação de classes BGC. Aqui, propomos um projeto conjunto entre o grupo de pesquisa da Divisão de Recursos Microbianos do Centro de Pesquisa em Química, Biologia e Agricultura (CPQBA) da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) e a Translational Genome Mining for Natural Products da Universidade de Tübingen (Alemanha). Sob a supervisão conjunta da Profa. Dra. Valéria de Oliveira e da Profa. Dra. Nadine Ziemert, identificaremos clusters de genes biossintéticos de produtos naturais, avaliaremos sua distribuição no ambiente e priorizaremos genes biossintéticos com potencial para exibir novas funções bioativas através de análise centrada em genomas. (AU)

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