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Impactos da inclusão de corridas de homozigosidade em processos de acasalamento dirigido em uma população simulada de bovinos de corte

Processo: 21/11156-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de agosto de 2022
Vigência (Término): 29 de fevereiro de 2024
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Ricardo Vieira Ventura
Beneficiário:Alana Selli
Instituição-sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Melhoramento animal   Seleção genômica

Resumo

Acasalamentos dirigidos podem ser conduzidos em programas de melhoramento a fim de promover a redução da endogamia sem comprometer o ganho genético de uma população. Entre os métodos utilizados para a caracterização de autozigose, destaca-se o uso das corridas de homozigosidade (ROH), que correspondem a cópias idênticas de haplótipos herdadas de um mesmo indivíduo. Este método permite a quantificação do coeficiente de endogamia genômico específico para cada indivíduo e a localização dos loci autozigotos no genoma. Desta forma, a inclusão das ROH pode oferecer um maior grau de detalhamento para o direcionamento de acasalamentos em programas de melhoramento animal, potencializando o ganho genético e ao mesmo tempo a redução do coeficiente de endogamia da população. Os objetivos deste projeto são (i) aplicar diferentes estratégias de seleção em relação aos perfis de ROH em uma população simulada, (ii) investigar o impacto de tais estratégias sob o ganho genético e parâmetros relacionados à variabilidade genética da população, e (iii) desenvolver uma interface que permita o acompanhamento de tal processo de seleção e a observação de seus impactos sobre cada componente do sistema. O programa AlphaSimR será utilizado para a simulação de uma população de bovinos de corte, com duas características quantitativas com herdabilidades distintas (h2 = 0.10 ou 0.30). Algumas gerações serão selecionadas por valor genético estimado e diferentes estratégias envolvendo corridas de homozigosidade, e posteriormente serão analisados alguns parâmetros relativos ao ganho genético e nível de endogamia da população, utilizando-se ferramentas computacionais que permitem que o usuário navegue ao longo das gerações e visualize diversos componentes do sistema, como genótipos, fenótipos, grupamentos genéticos, padrões de corridas de homozigosidade, desequilíbrio de ligação, entre outros.

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