Aspectos clínicos e interações hospedeiro-microbiota em infecção com variantes do SARS-CoV-2 em hamsters

Resumo

O aumento da gravidade da infecção por SARS-CoV-2 foi observado em pacientes obesos. No entanto, são escassas as informações sobre os mecanismos envolvidos na associação entre obesidade e patogênese da COVID-19. A microbiota intestinal surgiu recentemente como um componente essencial durante infecções virais respiratórias. O objetivo deste projeto é investigar o impacto da obesidade nos perfis da microbiota intestinal e correlacionar as alterações com a gravidade do COVID-19. Para isso, hamsters obesos (dieta rica em gordura) e magros serão infectados com SARS-CoV-2 e os parâmetros clínicos serão estudados. As fezes de hamsters infectados e não infectados serão coletadas em diferentes momentos (tempo precoce e tardio) pós-infecção para caracterização da microbiota. Metagenômica e metabolômica imparciais serão realizadas. A carga viral no pulmão, cólon e fígado será analisada por RT-PCR quantitativo. A barreira intestinal será estudada medindo-se a translocação de bactérias e LPS, espessura do muco e quantificação dos componentes da junção estreita (RT-qPCR, imuno-histoquímica). A inflamação sistêmica (citocinas, proteínas de fase aguda) será medida por ELISA e proteômica. Usando um pipeline interno de bioinformática baseado em R e Python, correlacionaremos conjuntos de dados microbianos e metabólitos com parâmetros de gravidade da infecção. Para estudar o papel da microbiota "disbiótica" na gravidade da doença, a microbiota intestinal de hamsters obesos será transferida para hamsters magros antes da infecção por SARS-CoV-2. Este estudo deve nos permitir decifrar melhor as consequências da obesidade na gravidade do COVID-19 e decifrar o papel potencial da funcionalidade da microbiota intestinal nos resultados da doença. (AU)