Bolsa 21/13906-4 - Leveduras, Hidrolisados de proteína - BV FAPESP
Busca avançada
Ano de início
Entree

Protocolos para mapeamentos de loci quantitativos em Saccharomyces cerevisiae baseados em seleções e retrocruzamentos em massa

Processo: 21/13906-4
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Data de Início da vigência: 01 de março de 2022
Situação:Interrompido
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Ana Paula Jacobus
Beneficiário:Lucas Souza de Bem
Instituição Sede: Instituto de Pesquisa em Bioenergia (IPBEN). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:17/24453-5 - Rede de colaboração: abordagens genéticas modernas para aumentar a tolerância de leveduras a hidrolisados lignocelulósicos enriquecidos, AP.BIOEN.JP
Bolsa(s) vinculada(s):23/06203-2 - ReMaSSing encontra SCRaMbLE: uso da recombinação por Cre/Lox, seleção e retrocruzamento para evoluir a levedura sintética Sc2.0, BE.EP.DD
Assunto(s):Leveduras   Hidrolisados de proteína   Materiais lignocelulósicos   CRISPR-Cas9   Bagaço de cana-de-açúcar   Locos de características quantitativas   Saccharomyces cerevisiae
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Cas9 | Crispr | engenharia genética | hidrolisado lignocelulósico | mapeamento de QTL | Qtl | Saccharomyces cerevisiae | Genética de leveduras

Resumo

O etanol de segunda geração (2G) é derivado de hidrolisados lignocelulósicos (HLCs). Estes contêm diversas substâncias tóxicas para a levedura Saccharomyces cerevisiae, diminuindo a eficiência fermentativa na produção do etanol 2G. Porém, algumas linhagens de S. cerevisiae são naturalmente resistentes aos HLCs. Uma maneira de analisar os fenótipos complexos destas cepas tolerantes é pelo mapeamento dos Loci de Traços Quantitativos (Quantitative Trait Loci, QTL). Para facilitar o estudo das diferenças genéticas entre linhagens tolerantes e sensíveis ao HLC, nós estamos desenvolvendo procedimentos inovadores de mapeamento de QTL em recombinantes haploides e diploides. Nos novos protocolos, após o cruzamento entre a linhagem sensível e tolerante, todos os recombinantes resultantes são selecionados em meio com HLC. Após cada retrocruzamento, pelo uso de antibióticos específicos, conseguimos permitir o crescimento apenas das células recombinantes e condicionar a ploidia da população. Desse modo, é possível realizar várias rodadas de seleção e retrocruzamento em massa. Atualmente, nós já efetuamos o sequenciamento genômico de um pool diploide resultante de cinco etapas de retrocruzamento e seleção em 35% de HLC de bagaço da cana-de-açúcar. Isso permitiu o mapeamento de várias regiões de QTL, as quais serão confirmadas por engenharia reversa via CRISPR/Cas9 na cepa sensível. No período de doutorado, esses dados somados ao mapeamento resultante do protocolo haploide, permitirão uma análise aprofundada do fenótipo de tolerância ao HLC em S. cerevisiae. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Mais itensMenos itens
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)