Desenvolvimento e aplicação de pipelines de bioinformática para análise metagenômica viral em amostras clínicas

Resumo

Os métodos metagenômicos são uma das ferramentas mais sensíveis para identificação de vírus emergentes. Com o advento das tecnologias de sequenciamento de última geração, a diversidade do software que é utilizado para a análise dos dados tem crescido significativamente. A análise bioinformática dos dados de sequenciamento de última geração ainda apresenta um desafio para interpretação correta dos dados obtidos devido a variabilidade dos programas utilizados para classificação taxonômica. Portanto, este Projeto tem como objetivo desenvolver e padronizar uma pipeline para metanálise de vírus a partir de dados de sequenciamento obtidos de diversas amostras clínicas (plasma de pacientes com câncer de próstata, doenças febris não identificadas e catadores de lixo). Ao mesmo tempo, serão conduzidas em paralelo comparações com outros programas de bioinformática e principalmente classificadores taxonômicos virais. Concomitantemente serão feitos ajustes nos bancos de dados dos classificadores uma vez que eles apresentam alta variabilidade dos dados taxonômicos virais disponíveis. Feito isso, será feita a montagem dos vírus identificados com importância clínica e os mesmos serão submetidos a análise filogenética com o intuito de investigar a epidemiologia molecular dos mesmos. Esse projeto permitirá a ter uma visão mais profunda no metaviroma de diversos grupos de pacientes. (AU)