O uso da técnica de enriquecimento híbrido ancorado (AHE) para análise da biodiversidade de Tanypodinae (Diptera: Chironomidae)

Resumo

O enriquecimento híbrido ancorado é uma forma de sequenciamento de última geração que usa sondas oligonucleotídicas para atingir regiões conservadas do genoma sobrepostas por regiões menos conservadas, a fim de adquirir dados úteis para a inferência filogenética de uma ampla gama de táxons. Originalmente desenvolvido para pesquisas médicas em doenças humanas, o enriquecimento híbrido é uma técnica flexível para a qual aplicações em pesquisa filogenômica estão apenas começando a ser percebidas. Ao contrário da reação em cadeia da polimerase tradicional (PCR), técnicas de enriquecimento híbrido podem ser usadas para isolar e amplificar muitos loci em uma única reação e, assim, melhorar significativamente a representação de espécies únicas em termos de cobertura gênica em análises filogenômicas. Além disso, uma vez desenvolvido o kit de sondas, o custo de um projeto aumenta principalmente pelo número de táxons adicionados, ao contrário do sequenciamento de Sanger, que aumenta pelo número de táxons e loci adicionados. Dessa forma, neste estudo todas as sequências de DNA serão inicialmente geradas a partir da técnica de enriquecimento híbrido ancorado, inédita no país. (AU)