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Análise sistemática comparativa de transcriptomas na elucidação de potenciais alvos antifúngicos

Processo: 21/10359-2
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de novembro de 2021
Vigência (Término): 31 de outubro de 2023
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Nilce Maria Martinez-Rossi
Beneficiário:Monise Fazolin Petrucelli
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:19/22596-9 - Mecanismos moleculares associados à patogenicidade e resistência em fungos: estratégias para o tratamento de dermatofitoses, AP.TEM
Assunto(s):Transcriptoma

Resumo

Modelos computacionais que objetivam a identificação sistemática de potenciais alvos antifúngicos foram utilizados com sucesso para fungos como Aspergillus fumigatus e leveduras, e evidenciam o potencial uso de sequenciamento em larga escala com esta finalidade. O genoma de diversos fungos patogênicos, incluindo os dermatófitos, é conhecido e contribui fortemente para as análises comparativas e a identificação de classes de genes enriquecidas no genoma de espécies ou grupos de fungos específicos e que estão associadas à adaptação a determinado nicho e ao estilo de vida desses fungos. Além da análise comparativa de genomas, as abordagens correntemente empregadas para a identificação de alvos moleculares putativos avaliam o fluxo metabólico, compilam dados sobre a expressão dos genes em condições específicas e estabelecem um "ranking" para alvos promissores, que também leva em consideração as análises dos domínios, estrutura tridimensional de proteínas e comparação com as proteínas ortólogas de humanos. Adicionalmente, o estudo sistemático das redes metabólicas pode requerer um estudo comparativo de linhagens, empregando a análise de coleções de mutantes.Nesta proposta pretende-se identificar nos dados gerados nos transcriptomas das linhagens de selvagem e mutantes de N. crassa e T. rubrum enzimas cruciais para o metabolismo e adaptação dos fungos frente às diferentes condições de cultivo, revelando de forma refinada alvos moleculares para o desenvolvimento de antifúngicos. (AU)

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