Análise do interactoma da proteína rev-erb-alfa através da imunoprecipitação da proteína alvo e identificação de possíveis ligantes por espectrometria de massa em cultura de células

Resumo

A análise da literatura científica sobre as proteínas relacionadas com a rev-erb-alfa revelou interações importantes com marcadores do ritmo circadiano como CLOCK (do inglês clock circadian regulator) e OPHN1 (do inglês oligophrenin 1) no contexto neuronal, e RORA (do inglês RAR related orphan receptor A) e NCOR1 (do inglês nuclear receptor corepressor 1) no contexto da repressão da transcrição, modulando por exemplo a expressão de proteínas relacionadas ao metabolismo como a PPARG4 (do inglês peroxisome proliferator activated receptor gamma). Entretanto, poucos estudos enfatizaram o papel da rev-erb-alfa no músculo esquelético e quais proteínas e vias moleculares a rev-erb-alfa é capaz de modular. De acordo com os nossos dados preliminares utilizando a análise de bioinformática (figura 2A-2C), a proteína rev-erb-alfa pode estar associada com outros eventos celulares e moleculares ainda não investigados no ME. O Prof. Dr. Fernando Moreira Simabuco (pesquisador associado do presente projeto temático) tem utilizado a análise do interactoma de proteínas celulares para revelar novas vias de sinalização e funções para proteínas conhecidas ou com funções ainda a serem determinadas. Nesse sentido, como forma de identificar novas proteínas de interação e vias moleculares relacionadas com a rev-erb-alfa no contexto da miogênese e metabolismo muscular, o subprojeto 3 analisará o interactoma da rev-erb-alfa em células musculares C2C12. (AU)