Análise filogenética do SARS-CoV-2 na cidade de São Paulo

Resumo

Os conhecimentos sobre os mecanismos evolutivos do SARS-CoV-2 são importantes para compreender seu padrão de comportamento e, assim, mitigar a pandemia. A intensa dispersão do vírus torna mais difícil que ele seja controlado. Ao sequenciar um vírus e comparar as sequências geradas, com outras sequências disponíveis nos bancos de dados, é possível compreender suas origens, mecanismos de evolução, cadeias de transmissão, e então fornecer maior conhecimento que poderá ser utilizado para o controle e prevenção das infecções. Este estudo tem como objetivo realizar uma análise filogenética de genomas de SARS-CoV-2 gerados a partir de amostras de pacientes provenientes da Cidade de São Paulo, em adição a sequências genômicas disponibilizadas em bancos de dados. Os novos genomas serão gerados utilizando sequenciamento genômico de nova geração baseado em nanoporos ou Illumina e análise filogenética será realizada utilizando ferramentas de bioinformática. Espera-se como resultado compreender como se deu a transmissão epidêmica e a trajetória evolutiva das linhagens de SARS-CoV-2 na cidade de São Paulo. (AU)