Bolsa 21/08158-9 - Cristalografia de proteínas, Septinas - BV FAPESP
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Estudos cristalográficos de septinas, seus domínios e seus complexos

Processo: 21/08158-9
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2021
Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2025
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Richard Charles Garratt
Beneficiário:Diego Antonio Leonardo Cabrejos
Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:20/02897-1 - Filamentos de septinas: estrutura, polimerização e atuação em patologias, AP.TEM
Bolsa(s) vinculada(s):24/18756-9 - Explorando mudanças conformacionais induzidas por GTP em septinas usando crio-EM de alta resolução, BE.EP.PD
Assunto(s):Cristalografia de proteínas   Septinas   Biologia estrutural   Difração por raios X   Microscopia crioeletrônica
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Biologia Estrutural | Complexo proteico | difração de raios-X | filamento protéico | septinas | cristalografia de proteínas

Resumo

O papel principal do bolsista de pós-doutorado será consolidar a posição de liderança em cristalografia de septinas que o grupo proponente do projeto temático atualmente ocupa. Ainda há questões sobre a relação estrutura/função das septinas que necessitam de esclarecimentos e onde a determinação de novas estruturas crisatalográficas tem muito a contribuir. Considerando a existência de oligômeros de septinas humanas tanto hexaméricas quanto octaméricas, existem seis diferentes tipos de interface septina-septina que podem existir quando tais oligômeros se associam para formar filamentos. Resultado dos esforços do nosso grupo ao logo dos últimos cinco anos, quatro destas interfaces são agora conhecidas em alta resolução. Parte da presente proposta, portanto, abordará as duas interfaces faltantes para podermos reconstruir uma imagem completa do filamento com detalhes atômicos (uma abordagem de "dividir para conquistar"). Assim, este trabalho será complementar ao projeto de outro pós-doutorado que focará estudos do heterocomplexo completo usando crio-microscopia eletrônica. As interfaces de interesse são formadas entre membros do grupo da SEPT6 e SEPT7 e o homodímero formado pela SEPT2. Para establizar a primeira interface um mutante já planejado será empregado. Para o caso da interface SEPT2-SEPT2, utilizaremos novas construções incluíndo a hélice ±0 no intuito de obter cristais que difratem a mais alta resolução comparado com os já relatados na literatura. Além disto, o bolsista continuará com esforços de cristalizar outras combinações de septinas para ampliar o nosso conhecimento sobre os detalhes de seletividade específica entre pares de septinas. Por exemplo, as primeiras estruturas a alta resolução de um heterocomplexo dimérico resolvidas por nosso grupo, permitiram levantar a hipótese de uma possível ligação covalente entre subunidades envolvendo as cadeias laterais de uma cisteína (SEPT2) e uma lisina (SEPT6). Porém, nem sempre estes resíduos são conservados em todos os membros dos grupos. As consequências desta variação sequencial em termos de preferências pela formação de pares específicos merecem ser investigadas. Finalmente, o pós-doutor será responsável em continuar as nossas tentativas de cristalizar um complexo hexamérico (ou octamérico) completo. (AU)

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MENDONCA, DEBORAH C.; MORAIS, SINARA T. B.; CIOL, HELOISA; PINTO, ANDRESSA P. A.; LEONARDO, DIEGO A.; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ; VALADARES, NAPOLEAO F.; V. PORTUGAL, RODRIGO; KLAHOLZ, BRUNO P.; GARRATT, RICHARD C.; et al. Structural Insights into Ciona intestinalis Septins: Complexes Suggest a Mechanism for Nucleotide-dependent Interfacial Cross-talk. Journal of Molecular Biology, v. 436, n. 16, p. 20-pg., . (21/10247-0, 21/08158-9, 23/06866-1, 18/20209-5, 20/02897-1)
FERNANDES, ADRIANO DE FREITAS; LEONARDO, DIEGO ANTONIO; CAVINI, ITALO AUGUSTO; ROSA, HIGOR VINICIUS DIAS; VARGAS, JHON ANTONI; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; GARRATT, RICHARD CHARLES. Conservation and divergence of the G-interfaces of Drosophila melanogaster septins. CYTOSKELETON, v. N/A, p. 16-pg., . (14/15546-1, 19/22000-9, 20/03983-9, 17/18173-0, 20/02897-1, 18/19992-7, 21/08158-9)
MENDONCA, D.; MORAIS, S.; PINTO, A.; LEONARDO, D.; VALADARES, N.; PORTUGAL, R.; KLAHOLZ, B.; GARRATT, R.; ARAUJO, A. P.. How to self assemble: oligomeric structures of septin complexes and sub-complexes from Ciona intestinalis. FEBS OPEN BIO, v. 14, p. 1-pg., . (21/08158-9, 20/02897-1, 23/06866-1, 18/20209-5)
SILVA, RAFAEL MARQUES DA; SALADINO, GIOVANNA CHRISTE DOS REIS; LEONARDO, DIEGO ANTONIO; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ; ARAUJO, ANA PAULA ULIAN; GARRATT, RICHARD CHARLES. A key piece of the puzzle: The central tetramer of the Saccharomyces cerevisiae septin protofilament and its implications for self-assembly. Journal of Structural Biology, v. 215, n. 3, p. 13-pg., . (21/08158-9, 20/02897-1, 22/00125-7, 14/15546-1, 18/09687-2)

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