Identificação de variantes com potencial regulador sobre características de qualidade de carne de gado Nelore

Resumo

O rebanho bovino brasileiro é composto majoritariamente por animais Nelore (Bos indicus), e seus cruzamentos. Embora sejam animais melhor adaptados ao clima tropical, apresentam carne com menos gordura intramuscular e menos macia em comparação aos animais de origem taurina. A expressão dos genes potencialmente associados à qualidade da carne bovina pode apresentar distorções em relação ao modelo aditivo, modelo universalmente adotado nas predições de valor genético dos animais, afetando a eficácia do processo de seleção. Quando um gene tem expressão alelo-específica (ASE, do inglês Allele-Specific Expression), a sua expressão é desbalanceada favorecendo um alelo e, se influenciada pelo efeito parental, ocorre o imprinting genômico. Mecanismos epigenéticos e cis-reguladores podem ser responsáveis por esses padrões quando o SNP regulador estiver em heterozigose. Assim, a fim de analisar a implicação da ASE sobre o melhoramento de Nelore, esse estudo irá associá-la diretamente aos fenótipos de qualidade de carne e avaliar o impacto do imprinting genômico, por meio da inclusão do efeito de origem parental nos modelos de análise de associação genômica global (Parent of Origin Genome Wide Association Studies- PO-GWAS), comparando aos resultados de GWAS obtidos sem a inclusão da origem parental do alelo. Esses dados serão integrados aos SNPs com ASE de uma população de bovinos da raça Limousin. Essa última abordagem visa analisar o quanto o padrão de expressão dessas variantes é conservado entre populações bovinas distintas. Os resultados contribuirão para a identificação de variantes reguladoras com potencial de aplicação ao melhoramento da qualidade da carne de Nelore. (AU)