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Métodos para mapeamento de QTL através de marcadores tipo SNP em dados familiares: uma revisão

Processo: 21/06131-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de setembro de 2021
Vigência (Término): 31 de agosto de 2022
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Probabilidade e Estatística - Estatística
Pesquisador responsável:Daiane Aparecida Zuanetti
Beneficiário:Lara Midena João
Instituição-sede: Centro de Ciências Exatas e de Tecnologia (CCET). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Assunto(s):Marcadores genéticos   Mapeamento   Modelos lineares mistos   Modelos de regressão

Resumo

O mapeamento de regiões no genoma associadas a traços quantitativos (QTLs) através de marcadores genéticos do tipo SNP tem sido um dos problemas centrais em Genética e Biologia Molecular e vários métodos de detecção e identificação de QTLs tem sido proposto na literatura. Neste trabalho, vamos pesquisar, estudar e descrever os principais métodos que tem sido utilizado para esse fim em dados familiares. Metodologias que analisam amostras em família são geralmente mais complexas do que metodologias que assumem independência entre os indivíduos, pois elas precisam considerar e descrever a associação genética que existe entre indivíduos da mesma família, além de identificar e selecionar os SNPs mais relevantes para explicar a variabilidade do traço quantitativo em estudo. Também vamos destacar suas vantagens e desvantagens e elencar os algoritmos que já estão implementados e disponíveis para utilização. O desempenho das diferentes metodologias estudadas será comparado via análise dos dados familiares GAW17.(AU)

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