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Aplicação de metagenômica shotgun para detalhar a diversidade taxonômica e funcional do microbioma de Nelore associado a fatores dietéticos e fenotípicos

Processo: 20/15565-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de julho de 2021
Vigência (Término): 30 de junho de 2023
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Luciana Correia de Almeida Regitano
Beneficiário:Liliane Costa Conteville
Instituição-sede: Embrapa Pecuária Sudeste. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Brasil). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:19/04089-2 - O Hologenoma de Nelore: implicações na qualidade de carne e em eficiência alimentar, AP.ESCIENCE.TEM
Assunto(s):Biomarcadores   Bos taurus indicus   Biologia molecular

Resumo

A ação de microrganismos abrigados no rúmen (microbioma) e da ruminaçãopermitem que os ruminantes obtenham nutrientes e energia a partir do consumo deplantas. Além de modular a saúde e fisiologia dos animais, o microbioma é responsávelpor diversos fenótipos que impactam fatores ambientais e econômicos. O metanoproduzido no rúmen contribui significativamente na pegada ambiental da pecuária. Aseficiências alimentar e hídrica são altamente relevantes para a sustentabilidade dossistemas de produção de bovinos. Considerando a importância do microbioma paradiversos aspectos da produção, desenhamos o presente projeto. Aplicaremosmetagenômica shotgun para analisar o microbioma ruminal de bovinos Nelore brasileirossubmetidos a diferentes dietas e estudaremos sua associação com emissão de metano,eficiência alimentar e pegada hídrica. Este projeto estará vinculado ao projeto temático"The Nelore hologenome: implications in beef quality and feed efficiency", pois contribuirácom seu objetivo geral, que visa estudar a interação dos genomas dohospedeiro/microbioma e sua relação com fenótipos bovinos. A metagenômica, diferentede análises prévias, permitirá a ampla caracterização da comunidade microbiana, semvieses de amplificação e seleção de alvos, possibilitando a recuperação de genomas,análises taxonômicas, gênicas e funcionais. O aprofundamento no conhecimento dosmicrobiomas ruminais impactará diretamente na criação e implementação de estratégiaspara diminuir a pegada ambiental da pecuária. E em conjunto com o genoma funcionalbovino, metaboloma e metatranscriptoma, que serão produzidas pelo projeto temático, osmetagenomas gerados pelo presente projeto irão compor uma inigualável base para oestudo das interrelações funcionais do "hologenoma" do Nelore. (AU)

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