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Caracterização da inativação de sequências autossômicas em indivíduos com translocações X-autossomo não equilibradas

Processo: 20/16422-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de junho de 2021
Vigência (Término): 31 de maio de 2024
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Maria Isabel de Souza Aranha Melaragno
Beneficiário:Bianca Pereira Favilla
Instituição-sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:19/21644-0 - Impacto de variantes genéticas na estabilidade do genoma e seus efeitos no fenótipo, AP.TEM
Assunto(s):Cromossomo X   Metilação de DNA   Análise de sequência de RNA   Genética médica

Resumo

Rearranjos envolvendo o cromossomo X apresentam peculiaridades em decorrência da inativação não casual do cromossomo X, sendo que nos casos de translocações X-autossomo não equilibradas, a inativação do cromossomo X (ICX) ocorre preferencialmente no cromossomo alterado. Nos raros casos de derivados do cromossomo X contendo o centro de inativação e sequências de cromossomos autossomos, pode haver inativação dessas sequências autossômicas além das do cromossomo X. Nesses casos, a propagação da ICX para sequências autossômicas pode ter impacto fenotípico direto, a depender dos genes que são inativados. Há poucos estudos que analisaram o perfil de metilação do DNA e expressão de genes autossômicos nesses casos, nenhum deles realizando análises comparando diretamente cromossomos translocados e seus homólogos normais do mesmo paciente quanto aos níveis de metilação do DNA e expressão de todos os genes envolvidos nas translocações. No presente trabalho, a caracterização da propagação da inativação do cromossomo X para sequências autossômicas em pacientes com translocações X-autossomo não equilibradas será realizada pela análise de metilação cromossomo-específica comparando-se os dados de sequenciamento com bissulfito de sódio dos cromossomos autossomos translocados e de seus homólogos normais, obtidos por microdissecção cromossômica, além da análise de expressão gênica alelo-específica por RNA-seq. Serão avaliados ainda, in silico, elementos de DNA e a organização dos domínios topologicamente associados (TADs) nas regiões autossômicas que possam influenciar a propagação da inativação. Os dados obtidos permitirão a caracterização cromossomo-específica do processo de propagação da ICX, auxiliando na compreensão do papel de elementos de DNA e cromatina nesse processo e das suas consequências clínicas.

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