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Morcegos: vigilância epidemiológica, filodinâmica de alta resolução, busca e design de peptídeos de interesse biotecnológico em vírus emergentes e reemergentes

Processo: 21/03684-4
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Jovens Pesquisadores
Vigência (Início): 01 de maio de 2021
Vigência (Término): 30 de abril de 2025
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Medicina Veterinária Preventiva
Pesquisador responsável:Ricardo Durães de Carvalho
Beneficiário:Ricardo Durães de Carvalho
Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:19/01255-9 - Morcegos: vigilância epidemiológica, filodinâmica de alta resolução, busca e design de peptídeos de interesse biotecnológico em vírus emergentes e reemergentes, AP.JP
Assunto(s):Vigilância epidemiológica   Virologia   Vírus de RNA   Zoonoses por vírus   Infecções por Arbovirus   Filodinâmica   Metagenômica   Sequenciamento de nova geração   Computação de alto desempenho
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:filodinamica | Morcegos | peptídeos | Vigilância Epidemiológica | Vírus RNA | Virologia

Resumo

Vírus RNA são importantes agentes envolvidos em zoonoses emergentes e reemergentes, representando um importante problema de Saúde Pública. Este cenário vem sendo constantemente monitorado através de descobertas de novos patógenos, no qual, entra em consonância e interesse internacional visando a identificação de novos agentes com o intuito de responder às novas doenças antes de atingirem à população humana. Neste contexto, os morcegos, com um viroma ainda a ser acentuadamente explorado, cada vez mais vêm recebendo notória atenção por albergar diversos patógenos virais de importância médica (ex.: Nipah, Ebola, SARS-CoV, MERS-CoV e agora o SARS-CoV-2 [COVID-19] pandêmico). Por outro lado, destacam-se os arbovírus, também detectados em morcegos. A saber, Chikungunya (CHIKV), Dengue 1-4 (DENVs), Mayaro (MAYV), Oropouche (OROV), Febre Amarela (YFV) e Zika (ZIKV), responsáveis por mais de 95% dos casos de infecção em todo o território brasileiro. Digno de nota, pesquisas mostram que kits diagnósticos comercialmente disponíveis para a detecção do CHIKV, DENV e ZIKV possuem grandes limitações e que o problema é agravado quanto se trata dos agentes reemergentes: MAYV, OROV e YFV. A presente proposta focará na investigação da presença de vírus RNA em morcegos e em abordagens envolvendo metagenômica e tecnologias de Sequenciamento de Nova Geração (NGS) objetivando identificar novos agentes de importância zoonótica assim como novos agentes arbovirais. Em paralelo, será implementada uma abordagem pioneira através do Estado-da-arte da filodinâmica utilizando a Computação de Alta Performance (HPC), fornecendo assim estratégias para o desenvolvimento de plataformas e workflows para o mapeamento e validação de peptídeos alvo-específicos com finalidade diagnóstica e terapêutica.

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Publicações científicas (7)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ANDREATA-SANTOS, ROBERT; JANINI, LUIZ M. R.; DURAES-CARVALHO, RICARDO. From Alpha to Omicron SARS-CoV-2 variants: What their evolutionary signatures can tell us?. Journal of Medical Virology, . (21/03684-4, 19/01255-9, 21/05661-1, 20/08943-5)
DE MELO, BRUNA A. G.; MUNDIM, MAYARA, V; LEMES, ROBERTHA M. R.; CRUZ, ELISA M.; RIBEIRO, TAIS N.; SANTIAGO, CAROLINA F.; DA FONSECA, JESSICA H. L.; BENINCASA, JULIA C.; STILHANO, ROBERTA S.; MANTOVANI, NATHALIA; et al. 3D Bioprinted Neural-Like Tissue as a Platform to Study Neurotropism of Mouse-Adapted SARS-CoV-2. ADVANCED BIOLOGY, v. 6, n. 8, p. 16-pg., . (21/03684-4, 20/05289-2, 18/23039-3, 19/01255-9, 18/12605-8)
JOAQUIM SILVA JUNIOR, JOSE VALTER; DURAES-CARVALHO, RICARDO; DE SOUZA, JOELMA RODRIGUES; RAMOS JANINI, LUIZ MARIO; WEIBLEN, RUDI; FLORES, EDUARDO FURTADO. Emergence of SARS-CoV-2 serotype(s): Is it a matter of time?. VIROLOGY, v. 585, p. 4-pg., . (19/01255-9, 20/08943-5, 21/03684-4)
DE SOUSA, LARISSA L. F.; DE SOUZA, TATIANE L.; TIBO, LUIZ H. S.; MOURA, FRANCISCO B. P.; JUNIOR, FRANCISCO A. S.; DE OLIVEIRA-FILHO, EDMILSON F.; LUDWIG-BEGALL, LOUISA F.; CABRAL-MIRANDA, GUSTAVO; ANDREATA-SANTOS, ROBERT; JANINI, LUIZ M. R.; et al. Rabies virus variants from bats closely related to variants found in marmosets (Callithrix jacchus), a neglected source of human rabies infection in Brazil. Journal of Medical Virology, v. 95, n. 8, p. 8-pg., . (19/01255-9, 22/09684-9, 21/03684-4, 22/08748-3)
PINHEIRO, JOSILENE R.; DOS REIS, ESTHER C.; FARIAS, JESSICA P.; FOGACA, MAYANNA M. C.; DA SILVA, PATRICIA DE S.; SANTANA, ITANA VIVIAN R.; ROCHA, ANA LUIZA S.; VIDAL, PALOMA O.; SIMOES, RAFAEL DA C.; LUIZ, WILSON B.; et al. Impact of Early Pandemic SARS-CoV-2 Lineages Replacement with the Variant of Concern P.1 (Gamma) in Western Bahia, Brazil. Viruses-Basel, v. 14, n. 10, p. 12-pg., . (19/01255-9, 21/03684-4)
NUNES, DANILO ROSA; BRACONI, CARLA TORRES; LUDWIG-BEGALL, LOUISA F.; ARNS, CLARICE WEIS; DURAES-CARVALHO, RICARDO. Deep phylogenetic-based clustering analysis uncovers new and shared mutations in SARS-CoV-2 variants as a result of directional and convergent evolution. PLoS One, v. 17, n. 5, p. 14-pg., . (19/01255-9, 21/03684-4)
DOS SANTOS, DEBORA REGINA LOPES; DURAES-CARVALHO, RICARDO; GARDINALI, NOEMI ROVARIS; MACHADO, LAIS CESCHINI; DE PAULA, VANESSA SALETE; WALLAU, GABRIEL DA LUZ; DE OLIVEIRA, JAQUELINE MENDES; PENA, LINDOMAR JOSE; PINTO, MARCELO ALVES; GIL, LAURA HELENA VEGA GONZALEZ; et al. Uncovering neglected subtypes and zoonotic transmission of Hepatitis E virus (HEV) in Brazil. VIROLOGY JOURNAL, v. 20, n. 1, p. 7-pg., . (19/01255-9, 21/03684-4)

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