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Estudos de associação genômica com sequência completa do genoma para características de crescimento em Nelore usando normas de reação

Processo: 20/14846-2
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2022
Vigência (Término): 31 de julho de 2022
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Roberto Carvalheiro
Beneficiário:Ivan Carvalho Filho
Supervisor no Exterior: Flavio Schramm Schenkel
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Local de pesquisa: University of Guelph, Canadá  
Vinculado à bolsa:19/06361-1 - Interação genótipo-ambiente em bovinos Nelore para características de crescimento e escores visuais com utilização de dados de sequência, BP.DR
Assunto(s):Estudo de associação genômica ampla   Gado Nelore   Melhoramento genético animal

Resumo

A interação genótipo-ambiente para bovinos de corte é rotineiramente investigada por meio de modelos de norma de reação para predizer os valores genéticos nas diferentes condições ambientais, bem como para avaliar a sensibilidade ambiental. A inclusão de marcadores moleculares na estimativa das normas de reação permite a identificação de genes candidatos ao longo dos gradientes ambientais por meio de estudos de associação do genoma. O objetivo deste projeto é realizar estudos de associação em todo o genoma usando dados de sequenciamento para mapear genes candidatos para características em diferentes gradientes ambientais. Serão utilizados cerca de um milhão de registros fenotípicos de bovinos Nelore criados em fazendas localizadas no Brasil e no Paraguai. As características que serão avaliadas são ganho de peso do nascimento ao desmame e ganho de peso do desmame ao sobreano. Um total de 151 touros foram sequenciados e os animais com informações do painel de HD tiveram seus genótipos imputados para toda a sequência do genoma totalizando mais de 10.000 animais com a sequência completa do genoma. Os estudos de associação de todo o genoma serão realizados usando a abordagem GBLUP de etapa única. Uma rede de genes agrupados funcionalmente em termos biológicos será construída a fim de investigar evidências da associação de processos biológicos que estão relacionados à sensibilidade à variação ambiental.

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