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Análise in silico para definição de common core microbiano associado a condições com degradação de surfactante aniônico Alquilbenzeno Linear Sulfonado (LAS)

Processo: 20/04297-1
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2021
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2021
Área do conhecimento:Engenharias - Engenharia Sanitária - Tratamentos de Águas de Abastecimento e Residuárias
Pesquisador responsável:Iolanda Cristina Silveira Duarte
Beneficiário:Isadora Soares de Lima
Instituição-sede: Centro de Ciências Humanas e Biológicas (CCHB). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Sorocaba , SP, Brasil
Assunto(s):Biologia computacional   RNA ribossômico   Tratamento de águas residuárias   Tratamento anaeróbio   Biodegradação   Reatores biológicos   Ensaios físico-químicos   Análise in silico

Resumo

O objetivo do projeto é definir o "common core" microbiano associado a condições com degradação do surfactante aniônico Alquilbenzeno Linear Sulfonado (LAS), a partir de mineração de dados disponíveis em banco de dados públicos contendo sequências do gene rRNA 16S. Para isso, as sequências analisadas serão provenientes de 11 trabalhos científicos distintos direcionados ao tratamento de surfactante aniônico (LAS) em diferentes águas residuárias. Ressalta-se que as sequências estão disponíveis em bancos de dados públicos. Os objetivos desse trabalho serão: (I) avaliar a diversidade e riqueza microbiana do Domínio Archaea e Bacteria por meio da análise in silico de dados oriundos de bancos de dados públicos contendo sequências do gene rRNA 16S; (II) predizer o perfil funcional das taxonomias obtidas, utilizando para isso o programa PICRUSt2; (III) analisar de forma integrada os dados físico-químicos disponíveis nos artigos publicados com as taxonomias obtidas nas análises; e (IV) definir e elaborar tutoriais específicos para análises de bioinformática no LINUX e estatística no R. Dessa forma, o presente trabalho contribuirá com os dados taxonômicos dos gêneros bacterianos pertencentes ao common core microbiano associado com a degradação de LAS, permitindo assim expandir o conhecimento das relações entre os microrganismos atuantes no processo. Com isso, poder-se-á aperfeiçoar os consórcios bacterianos utilizados nos reatores biológicos, tornando-os mais eficientes na remoção do surfactante aniônico.

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