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Análise coarse-graining da interação entre vesículas lipídicas e peptídeos antimicrobianos e penetradores de células

Processo: 19/26557-8
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
Vigência (Início): 22 de setembro de 2020
Vigência (Término): 21 de setembro de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Iolanda Midea Cuccovia
Beneficiário:Peter Park
Supervisor no Exterior: Siewert Jan Marrink
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Local de pesquisa: University of Groningen, Holanda  
Vinculado à bolsa:19/03023-8 - Como adentram a membrana os peptídeos penetradores de células?, BP.DD
Assunto(s):Peptídeos catiônicos antimicrobianos   Peptídeos penetradores de células   Simulação de dinâmica molecular   Membranas

Resumo

Peptídeos catiônicos atuantes em membranas (CMAP) são protagonistas em diversos processos que envolvem membranas lipídicas como formação de poro, fusão de vesículas e ruptura. Dois grupos dos CMAP se destacam como potenciais fármacos inovadores ou como carreadores de fármacos. Peptídeos antimicrobianos (AMP) são uma classe promissora de agentes antimicrobianos e peptídeos penetradores de células (CPP) já estão em fase de teste para drug-delivery. Muitos AMP e CPP foram descobertos e tiveram suas estruturas secundárias analisadas em membranas modelo e testadas in vitro. Contudo, o seu mecanismo de ação exato ainda é obscuro, sendo um obstáculo para o uso dos CMAP na terapêutica. Simulações de Dinâmica Molecular podem fornecer informações atomísticas relevantes e têm sido utilizadas para muitos sistemas peptídeo/membrana, mas em proporções peptídeo/lipídeo baixas.Neste trabalho, propomos estudar o peptídeo TAT e BP100 em vesículas em concentrações crescentes dos peptídeos utilizando um modelo coarse-graining. As informações obtidas nos proverão informações cruciais acerca da agregação de peptídeos, forma da vesícula e o efeito dos peptídeos nas vesículas. Estas são informações que podem ser diretamente comparadas com dados experimentais de membranas modelo, permitindo uma descrição detalhada da ação de AMP e CPP em membranas. (AU)

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