Aplicação de métodos de bioinformática para identificação de infecções virais com impacto em hemoterapia

Resumo

Desde que termo metagenômica foi utilizado pela primeira vez no meio científico pela para identificar comunidades microbianas ambientais por técnicas de sequenciamento do tipo shotgun ou sequenciamento de última geração (SNG) ambos os equipamentos e as aplicações da metagenômica evoluíram drasticamente. Ao longo do tempo, a metagenômica ambiental deu espaço para a utilização da metagenômica clínica, principalmente na caracterização de vírus emergentes. No Brasil, a análise do viroma na área da hemoterapia é ainda pouco praticada. Dentre os maiores desafios, destaca-se a análise bioinformática devido a problemas operacionais e computacionais bem como a falta de recursos devidamente capacitados para analisar o metaviroma. Esta proposta visa a aplicação das ferramentas bioinformáticas (pipelines de bioinformática) em dois aspectos. Por um lado, será avaliada a presença de vírus emergentes em bolsas de sangue indeferidas para doação devido a informação pós-doação (tratamento com hemoderivados) e pacientes com transplante de células-tronco hematopoiéticas (pacientes receptores de hemoderivados). Neste panorama destacam-se os pacientes com transplante hematopoiético que por um lado podem apresentar reativação de várias infecções virais, porém, por outro devido a profunda imunossupressão podem servir como hospedeiros para vírus emergentes. Visando um melhor entendimento das possíveis infecções virais encontradas em hemoderivados e pacientes com transplante hematopoiético, este trabalho visa a aplicação de um pipeline de bioinformática para análise de dados metagenômicos provenientes de SNG. Serão incluídos passos e softwares que visam extrair o máximo de informações possíveis dos vírus presentes nas amostras. Esse trabalho contará com a ajuda de pesquisadores bioinformatas do Instituto Pasteur, Paris, França e o Instituto Nacional de Transfusão Sanguínea da França, Paris, França. (AU)