Efeitos da depressão endogâmica sobre características de produção de leite em búfalas Murrah

Resumo

Acasalamentos entre indivíduos aparentados originam progênie com níveis de heterozigosidade reduzida, elevando riscos de depressão endogâmica, que causa a redução no valor fenotípico médio para características de interesse econômico. Estimar o coeficiente de endogamia (F) e depressão endogâmica auxilia no direcionamento de programas de melhoramento, possibilitando o controle e manutenção da diversidade genética, evitando os efeitos da depressão endogâmica. O objetivo deste trabalho é estimar o coeficiente de endogamia por diferentes métodos e avaliar os efeitos da endogamia sobre características de produção de leite em búfalas Murrah. O grupo amostral será constituído por 289 búfalas Murrah genotipadas em painel para ~90,000 SNPs com Axiom Buffalo Genotyping, além de 384 animais que serão genotipados no mesmo painel. Os efeitos da depressão endogâmica serão avaliados para as características de produção de leite aos 305 dias (MP), porcentagem de gordura (%F) e a porcentagem de proteína (%P) no leite. As estimativas do F serão realizadas utilizados registros genealógico (pedigree, FPED) e informações genômicas (runs of homozygosity, FROH; genomic relationship matrix, GRM). A depressão endogâmica será estimada pela regressão dos fenótipos sobre os F. O modelo para cada característica será ajustado para (1) efeito fixo de grupo de contemporâneos, (2) idade da búfala ao parto e cada F como covariáveis, e como (3) aleatório os efeitos genético aditivo, ambiente permanente e residual.