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Predição genômica aplicada à seleção recorrente recíproca em milho tropical para eficiência no uso de nitrogênio

Processo: 17/25549-6
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de março de 2018
Vigência (Término): 30 de junho de 2020
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia
Pesquisador responsável:Roberto Fritsche Neto
Beneficiário:Júlia Silva Morosini
Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):19/06532-0 - Predição genômica aplicada à seleção recorrente recíproca em milho tropical para eficiência no uso do nitrogênio, BE.EP.DR
Assunto(s):Melhoramento genético vegetal   Acurácia
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Acurácia | grupo heterótico | Índice de Seleção | matriz de parentesco genômico | Melhoramento vegetal

Resumo

Um dos pressupostos da análise dialélica consiste em assumir que os genitores são não-aparentados, o que na prática não ocorre e, portanto, pode conduzir a resultados viesados. Ademais, outro fator crítico em um programa de melhoramento de híbridos é a predição genômica ser realizada com base nos mesmos efeitos de substituição alélica para dois grupos heteróticos complementares. Isto pode direcionar a uma seleção convergente de genitores e, consequentemente, reduzir a probabilidade de obter híbridos com alta heterose ao longo dos ciclos. Nesse sentido, os objetivos são: i) estimar o efeito da matriz de parentesco genômico nas estimativas em análises dialélicas; ii) identificar o efeito da modelagem diferencial dos efeitos de marcadores em função dos grupos heteróticos em uma população de melhoramento de milho via seleção recorrente recíproca. A abordagem de modelos mistos será utilizada para condução das análises fenotípicas, dialélicas e de predição genômica. Os dados fenotípicos serão produtividade e índices de resposta ao nitrogênio em milho tropical obtidos em dois conjuntos de dados, USP e empresa Helix sementes Ltda. Para o primeiro objetivo, será incluída a matriz de parentesco genômico de VanRaden nas análises dialélicas de forma a verificar o efeito desta nas capacidades geral e específica de combinação (CGC e CEC), na formação de grupos heteróticos e na escolha de testadores. No segundo objetivo, três modelos de predição serão testados: i) efeitos aditivos comuns para toda a população; ii) efeitos aditivos-dominantes comuns para toda a população e iii) efeitos aditivos específicos para cada grupo heterótico e interação entre grupos - delineamento II de North Carolina entre genitores de dois grupos heteróticos. A partir dos resultados, pretende-se avaliar o efeito desta modelagem na acurácia preditiva, variabilidade dentro e distancia genética entre os grupos heteróticos ao longo dos ciclos de seleção.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GALLI, GIOVANNI; ALVES, FILIPE COUTO; MOROSINI, JULIA SILVA; FRITSCHE-NETO, ROBERTO. On the usefulness of parental lines GWAS for predicting low heritability traits in tropical maize hybrids. PLoS One, v. 15, n. 2, . (13/24135-2, 17/24327-0, 17/25549-6)
MATIAS, FILIPE INACIO; MOROSINI, JULIA SILVA; ESPOLADOR, FERNANDO GARCIA; FRITSCHE-NETO, ROBERTO. Be-Breeder 2.0: A Web Application for Genetic Analyses in a Plant Breeding Context. CROP SCIENCE, v. 59, n. 4, p. 1371-1373, . (17/25549-6)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
MOROSINI, Júlia Silva. Inferindo padrões heteróticos e o efeito da incorporação de desvios de dominância na predição de híbridos: um exemplo em milho tropical sob condições de estresse de nitrogênio. 2020. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.

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