Efeitos do sulforafano nos padrões de metilação do DNA e análise do transcriptoma em células tumorais e não tumorais

Resumo

O câncer é um problema crescente de saúde humana em todo o mundo. A ocorrência de câncer está relacionada ao envelhecimento da população, bem como a prevalência de fatores de risco. Alterações epigenéticas e genéticas contribuem para a iniciação e progressão do câncer. A epigenética é uma herança não-mendeliana de modificações de DNA, que, não afetam a seqüência de base de DNA, mas podem influenciar a expressão de genes. Vários estudos sugerem que uma série de compostos da dieta desempenham um papel importante como moduladores epigenéticos contra a iniciação e a progressão de vários tipos de câncer. O sulforafano, um isotiocianato natural a partir de vegetais crucíferos, é um conhecido inibidor das histonas desacetilases. No entanto, a influência do sulforafano na metilação do DNA e no estado da condensação da cromatina não está totalmente clara. Novos métodos e progresso foram conquistados para identificar genes geralmente silenciados e alterações na expressão de mRNA. Portanto, o objetivo deste estudo é analisar o perfil geral de metilação do DNA de células tumorais e não tumorais, após o tratamento de sulforafano usando tecnologias de alto rendimento. Para encontrar regiões de interesse que são modificadas epigenéticamente pelo sulforafano, o RRBS (seqüenciamento de bisulfito de representação reduzida) será realizado. Além disso, para determinar a dinâmica da expressão gênica e alterações do transcriptoma em células cancerosas e não cancerosas após o tratamento de sulforafano por RNA-seq. Finalmente, para investigar a influência do sulforafano em proteínas relacionadas à condensação da cromatina, o método de imunoprecipitação da cromatina, seguido de uma sequenciamento de DNA (ChIP-Seq). Esses estudos fornecerão informações valiosas sobre a influência do sulforafano em todo o genoma e podem agregar relevância ao sulforafano como um promissor agente de prevenção do câncer.