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Caracterização estrutural das proteínas do vírus Zika e busca por agentes antivirais

Processo: 16/19712-9
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de novembro de 2016
Vigência (Término): 30 de setembro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Glaucius Oliva
Beneficiário:Andre Schutzer de Godoy
Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:13/07600-3 - CIBFar - Centro de Inovação em Biodiversidade e Fármacos, AP.CEPID
Assunto(s):Biologia estrutural   Planejamento de fármacos   Desenvolvimento de fármacos   Antivirais   Vírus Zika   Proteínas do capsídeo   Proteínas do envelope viral   Cristalografia de proteínas
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Cristalografia de Proteínas | desenvolvimento de antígenos virais específicos | planejamento e desenvolvimento de fármacos | proteinas do envelope e capsídeo | Proteínas Não-estruturais | Zika vírus | Biologia Estrutural e Planejamento de Fármacos

Resumo

A Febre Zika, causada pelo Zika Vírus (ZIKV), é uma doença emergente que em 2016 atingiu todos os continentes do globo, alcançando o estado de pandemia. Além dos sintomas similares aos da Dengue, a infecção pelo ZIKV também pode causar a má formação em fetos e problemas neurológicos em adultos, como a Síndrome de Guillain-Barré. Apesar dos esforços mundiais, os mecanismos de transmissão, replicação, evasão do sistema imunológico e efeitos deletérios do ZIKV não são bem compreendidos. Até o momento não existem tratamentos ou formas eficientes de erradicação do vírus, sendo que a prevenção e controle das populações de mosquito transmissor são as únicas formas de combate ao ZIKV. O ZIKV é um retrovírus de cadeia positiva, onde o material genético codifica uma poliproteína que forma dez proteínas maduras. Destas, duas formam o envelope viral, uma o capsídeo, e outras sete estão envolvidas no processo de replicação do vírus. As proteínas de envelope, e as proteínas NS1-dominio ladder, NS3-protease e NS5-methyltransferase já tiveram partes de suas estruturas cristalográficas resolvidas. Nossa proposta é estudar prioritariamente as proteínas cujas estruturas não estão disponíveis utilizando técnicas de Biologia Molecular e cristalografia de raio-X, a fim de determinar as estruturas tridimensionais das mesmas. Vamos também buscar expressar e cristalizar as proteínas já relatadas na literatura, pois o interesse maior do nosso grupo é a busca por ligantes candidatos a fármacos antivirais, usando a metodologia do planejamento de ligantes baseado na estrutura do receptor. Esse projeto está vinculado ao projeto CEPID CIBFar da FAPESP, e tem também como objetivo estabelecer uma base no grupo para estudos de vírus. (AU)

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Publicações científicas (12)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GODOY, ANDRE S.; LIMA, GUSTAVO M. A.; OLIVEIRA, KETLLYN I. Z.; TORRES, NAIARA U.; MALUF, FERNANDO V.; GUIDO, RAFAEL V. C.; OLIVA, GLAUCIUS. Crystal structure of Zika virus NS5 RNA-dependent RNA polymerase. NATURE COMMUNICATIONS, v. 8, . (14/50381-3, 13/07600-3, 16/17153-2, 15/16811-3, 16/19712-9)
FREIRE, MARJORIE C. L. C.; NOSKE, GABRIELA D.; BITENCOURT, NATALIA V.; SANCHES, PAULO R. S.; SANTOS-FILHO, NORIVAL A.; GAWRILJUK, VICTOR O.; DE SOUZA, EDUARDO P.; NOGUEIRA, VICTOR H. R.; DE GODOY, MARIANA O.; NAKAMURA, ALINE M.; et al. Non-Toxic Dimeric Peptides Derived from the Bothropstoxin-I Are Potent SARS-CoV-2 and Papain-like Protease Inhibitors. Molecules, v. 26, n. 16, . (18/17095-8, 20/04602-9, 13/07600-3, 20/05761-3, 20/12519-4, 18/25600-4, 16/19712-9, 16/13884-2, 18/13588-0)
NOSKE, G. D.; NAKAMURA, A. M.; GAWRILJUK, V. O.; FERNANDES, R. S.; LIMA, G. M. A.; ROSA, H. V. D.; PEREIRA, H. D.; ZERI, A. C. M.; NASCIMENTO, A. F. Z.; FREIRE, M. C. L. C.; et al. A Crystallographic Snapshot of SARS-CoV-2 Main Protease Maturation Process. Journal of Molecular Biology, v. 433, n. 18, . (15/16811-3, 16/19712-9, 13/07600-3)
RUIZ, URIEL ENRIQUE AQUINO; SANTOS, IGOR ANDRADE; GROSCHE, VICTORIA RIQUENA; FERNANDES, RAFAELA SACHETTO; GODOY, ANDRE SCHUTZER DE; TORRES, JHOAN DAVID AGUILLON; FREIRE, MARJORIE CAROLINE LIBERATO CAVALCANTI; MESQUITA, NATHALYA CRISTINA DE MORAES ROSO; GUEVARA-VEGA, MARCO; NICOLAU-JUNIOR, NILSON; et al. Imidazonaphthyridine effects on Chikungunya virus replication: Antiviral activity by dependent and independent of interferon type 1 pathways. VIRUS RESEARCH, v. 324, p. 14-pg., . (13/07600-3, 16/19712-9, 18/05130-3)
PUHL, ANA C.; BOGART, JONATHAN W.; HABERMAN, VICTORIA A.; LARSON, JACOB E.; GODOY, ANDRE S.; NORRIS-DROUIN, JACQUELINE L.; CHOLENSKY, STEPHANIE H.; LEISNER, TINA M.; FRYE, V, STEPHEN; PARISE, V, LESLIE; et al. Discovery and Characterization of Peptide Inhibitors for Calcium and Integrin Binding Protein 1. ACS Chemical Biology, v. 15, n. 6, p. 1505-1516, . (16/19712-9)
GODOY, ANDRE SCHUTZER; NAKAMURA, ALINE MINALLI; DOUANGAMATH, ALICE; SONG, YUN; NOSKE, GABRIELA DIAS; GAWRILJUK, VICTOR OLIVEIRA; FERNANDES, RAFAELA SACHETTO; PEREIRA, HUMBERTO D. MUNIZ; OLIVEIRA, KETLLYN IRENE ZAGATO; FEARON, DAREN; et al. Allosteric regulation and crystallographic fragment screening of SARS-CoV-2 NSP15 endoribonuclease. Nucleic Acids Research, v. 51, n. 10, p. 16-pg., . (13/07600-3, 15/16811-3, 16/19712-9)
NOSKE, GABRIELA DIAS; GAWRILJUK, VICTOR OLIVEIRA; FERNANDES, RAFAELA SACHETTO; FURTADO, NATHALIA DIAS; BONALDO, MYRNA CRISTINA; OLIVA, GLAUCIUS; GODOY, ANDRE SCHUTZER. Structural characterization and polymorphism analysis of the NS2B-NS3 protease from the 2017 Brazilian circulating strain of Yellow Fever virus. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS, v. 1864, n. 4, . (16/19712-9, 18/05130-3, 13/07600-3)
DE GODOY, ANDRE SCHUTZER; FERNANDES, RAFAELA SACHETTO; CAMPOS AGUIAR, ANNA CAROLINE; BUENO, RENATA VIEIRA; DE MORAES ROSO MESQUITA, NATHALYA CRISTINA; CARVALHO GUIDO, RAFAEL VICTORIO; OLIVA, GLAUCIUS. Structural and mechanistic insight from antiviral and antiparasitic enzyme drug targets for tropical infectious diseases. CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY, v. 59, p. 65-72, . (16/19712-9, 18/05130-3, 13/07600-3, 15/18192-9)
FERNANDES, RAFAELA S.; NOSKE, GABRIELA D.; GAWRILJUK, VICTOR O.; DE OLIVEIRA, KETLLYN I. Z.; GODOY, ANDRE S.; MESQUITA, NATHALYA C. M. R.; OLIVA, GLAUCIUS. High-throughput Antiviral Assays to Screen for Inhibitors of Zika Virus Replication. JOVE-JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTS, v. N/A, n. 176, p. 11-pg., . (13/07600-3, 16/19712-9, 18/05130-3)
NOSKE, GABRIELA DIAS; SONG, YUN; FERNANDES, RAFAELA SACHETTO; CHALK, ROD; ELMASSOUDI, HAITEM; KOEKEMOER, LIZBE; OWEN, C. DAVID J.; EL-BABA, TARICK V.; ROBINSON, CAROL; OLIVA, GLAUCIUS; et al. An in-solution snapshot of SARS-COV-2 main protease maturation process and inhibition. NATURE COMMUNICATIONS, v. 14, n. 1, p. 13-pg., . (13/07600-3, 16/19712-9)
FERNANDES, RAFAELA SACHETTO; DE GODOY, ANDRE SCHUTZER; SANTOS, IGOR ANDRADE; NOSKE, GABRIELA DIAS; DE OLIVEIRA, KETLLYN IRENE ZAGATO; GAWRILJUK, VICTOR OLIVEIRA; JARDIM, ANA CAROLINA GOMES; OLIVA, GLAUCIUS. Discovery of an imidazonaphthyridine and a riminophenazine as potent anti-Zika virus agents through a replicon-based high-throughput screening. VIRUS RESEARCH, v. 299, . (18/05130-3, 16/19712-9, 13/07600-3)
FERNANDES, RAFAELA S.; FREIRE, MARJORIE C. L. C.; BUENO, V, RENATA; GODOY, ANDRE S.; GIL, LAURA H. V. G.; OLIVA, GLAUCIUS. Reporter Replicons for Antiviral Drug Discovery against Positive Single-Stranded RNA Viruses. Viruses-Basel, v. 12, n. 6, . (16/19712-9, 18/05130-3, 13/07600-3, 18/17095-8)

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