Genômica funcional do timo humano: detecção de comunidades em redes de coexpressão gênica e estudo do controle transcricional

Resumo

O timo humano é um órgão linfóide primário que desempenha um papel crucial e único no desenvolvimento e maturação dos linfócitos T. Por ser um órgão muito dinâmico, sofre rápida alteração pelo tempo e estímulos exógenos e entram em um processo de involução, alterando a resposta imune dependentes dessas células. Neste projeto será conduzida uma investigação sobre a genômica funcional do timo humano (explantes cirúrgicos obtidos em cirurgia cardíaca) nos primeiros 30 meses de vida empregando-se metodologias de expressão gênica em larga escala (microarrays) e abordagens computacionais para identificação de comunidades de genes (análise de modularidade de repertórios transcricionais) em redes de coexpressão gênica. Esse estudo contempla uma série de indivíduos saudáveis, onde será estudada a variância dos perfis transcricionais em diferentes faixas etárias (grupos selecionados no intervalo de 0-30 meses). Como, possivelmente, as alterações dos perfis transcricionais e das redes de coexpressão gênica ao longo do tempo, envolvem mecanismos epigenéticos, será realizada adicionalmente, uma análise da expressão global de microRNAs. Os resultados obtidos serão validados por imunohistoquímica nas amostras de tecido tímico coletadas para os estudos genômicos. É importante ressaltar que a metodologia de detecção de comunidades em redes complexas está se afirmando como uma ferramenta essencial em estudos genômicos, com aplicações relevantes para a medicina baseada em redes (network medicine). A caracterização do timo em infantos saudáveis irá fornecer uma abordagem baseada em rede, bem como o entendimento dos mecanismos moleculares que controlam o timo durante os primeiros anos de vida, permitindo estudos comparativos com patologias associadas, como por exemplo cromossomopatias. (AU)