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Análise comparativa de genomas de estirpes de Streptococcus suis isoladas de suínos no Brasil

Processo: 15/26159-1
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de maio de 2016
Vigência (Término): 30 de setembro de 2019
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Medicina Veterinária Preventiva
Pesquisador responsável:Andrea Micke Moreno
Beneficiário:Carlos Emilio Cabrera Matajira
Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Sorotipagem   Tipagem de sequências multilocus   Eletroforese em gel de campo pulsado   Suínos   Genômica   Streptococcus suis   Microbiologia
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Análise genômica | Mlst | Pfge | Sorotipagem | Streptococcus suis | suíno | Microbiologia

Resumo

Streptococcus suis é um importante patógeno em sistemas de produção de suínos no mundo. Os sinais clínicos da infecção pelo agente são variáveis podendo-se observar meningite, artrite, poliserosite, pneumonia, infecção urinária e abortamento. Nos últimos anos, com o crescimento da tecnificação e a utilização de sistemas intensivos de produção suínos, a ocorrência de surtos de infecção por S. suis aumentou. O alto número de animais carreadores de S. suis nas criações e no momento do abate também aumenta o risco de contágio para os seres humanos envolvidos na cadeia produtiva, assim como para as pessoas que manipulam a carne "in natura". A infecção em humanos tem sido descrita em diversos países como causa de meningite, pneumonia, endocardite, septicemia e até morte. O presente projeto tem como objetivos a caracterização de 215 isolados de S. suis que ocasionaram surtos em granjas de suínos de diferentes Estados do País. Esta caracterização abrangerá a identificação dos sorotipos mais prevalentes, a determinação do perfil de resistência e as mudanças neste nos últimos 12 anos, avaliação das estirpes através da PFGE e sequenciamento do genoma de um grupo de estirpes selecionadas. A partir do sequenciamento dos genomas serão determinadas as sequências tipo (STs) que estão ocorrendo no país, os genes de resistência aos antimicrobianos e de virulência recentemente descritos. Estes dados servirão como base para estudos futuros no país envolvendo o controle da enfermidade na espécie suína e até de pesquisas envolvendo a ocorrência deste agente na espécie humana ou outras espécies animais.

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Publicações científicas (17)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MORENO, LUISA Z.; MATAJIRA, CARLOS E. C.; GOMES, VASCO T. M.; SILVA, ANA PAULA S.; MESQUITA, RENAN E.; CHRIST, ANA PAULA G.; SATO, MARIA INES Z.; MORENO, ANDREA M.. Molecular and antimicrobial susceptibility profiling of atypical Streptococcus species from porcine clinical specimens. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 44, p. 376-381, . (15/26159-1, 13/17136-2, 13/16946-0)
ABRAHAO, CARLOS R.; MORENO, LUISA Z.; SILVA, JEAN C. R.; BENITES, NILSON R.; MATAJIRA, CARLOS E. C.; FERREIRA, FERNANDO; MORENO, ANDREA M.; DIAS, RICARDO A.. Salmonella enterica in Invasive Lizard from Fernando de Noronha Archipelago: Serotyping, Antimicrobial Resistance and Molecular Epidemiology. MICROORGANISMS, v. 8, n. 12, . (15/26159-1, 16/25745-7)
MORENO, ANDREA MICKE; MORENO, LUISA ZANOLLI; POOR, ANDRE PEGORARO; MATAJIRA, CARLOS EMILIO CABRERA; MORENO, MARINA; DE MOURA GOMES, VASCO TULIO; RIBEIRO DA SILVA, GIVAGO FARIA; TAKEUTI, KARINE LUDWIG; BARCELLOS, DAVID EMILIO. Antimicrobial Resistance Profile of Staphylococcus hyicus Strains Isolated from Brazilian Swine Herds. ANTIBIOTICS-BASEL, v. 11, n. 2, p. 12-pg., . (11/08541-5, 13/17136-2, 15/26159-1, 13/16946-0)
MONTEIRO, MATHEUS SALIBA; MATIAS, DEBORA NOVAIS; POOR, ANDRE PEGORARO; DUTRA, MAURICIO CABRAL; MORENO, LUISA ZANOLLI; PARRA, BEATRIZ MARTINS; SILVA, ANA PAULA SANTOS; CABRERA MATAJIRA, CARLOS EMILIO; DE MOURA GOMES, VASCO TULIO; FUNADA BARBOSA, MIKAELA RENATA; et al. Causes of Sow Mortality and Risks to Post-Mortem Findings in a Brazilian Intensive Swine Production System. ANIMALS, v. 12, n. 14, p. 18-pg., . (19/01192-7, 19/17683-0, 15/26159-1, 16/25745-7)
MATAJIRA, CARLOS E. C.; MORENO, LUISA Z.; POOR, ANDRE P.; GOMES, VASCO T. M.; DALMUTT, ANDRESSA C.; PARRA, BEATRIZ M.; DE OLIVEIRA, CAROLINA H.; BARBOSA, MIKAELA R. F.; SATO, MARIA INES Z.; CALDERARO, FRANCO F.; et al. Streptococcus suis in Brazil: Genotypic, Virulence, and Resistance Profiling of Strains Isolated from Pigs between 2001 and 2016. PATHOGENS, v. 9, n. 1, . (17/09515-4, 15/26159-1, 16/25745-7, 19/01192-7)
MATAJIRA, CARLOS E. C.; MORENO, LUISA Z.; GOMES, VASCO T. M.; SILVA, ANA PAULA S.; MESQUITA, RENAN E.; DOTO, DANIELA S.; CALDERARO, FRANCO F.; DE SOUZA, FERNANDO N.; CHRIST, ANA PAULA G.; SATO, MARIA INES Z.; et al. Evaluation of protein spectra cluster analysis for Streptococcus spp. identification from various swine clinical samples. JOURNAL OF VETERINARY DIAGNOSTIC INVESTIGATION, v. 29, n. 2, p. 245-249, . (15/26159-1, 13/17136-2, 13/16946-0)
MORENO, LUISA Z.; MATAJIRA, CARLOS E. C.; POOR, ANDRE P.; MESQUITA, RENAN E.; GOMES, VASCO T. M.; SILVA, ANA PAULA S.; AMIGO, CRISTINA R.; CHRIST, ANA PAULA G.; BARBOSA, MIKAELA R. F.; SATO, MARIA INES Z.; et al. Identification through MALDI-TOF mass spectrometry and antimicrobial susceptibility profiling of bacterial pathogens isolated from sow urinary tract infection. VETERINARY QUARTERLY, v. 38, n. 1, p. 1-8, . (15/26159-1, 16/25745-7)
FRANCO F. CALDERARO; LUISA Z. MORENO; DANIELA S. DOTO; CARLOS E.C. MATAJIRA; VASCO T.M. GOMES; THAIS S.P. FERREIRA; RENAN E. MESQUITA; ANDREA M. MORENO. Caracterização de Streptococcus suis por sorotipagem, SE-AFLP e perfil de virulência. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 36, n. 8, p. 701-704, . (15/26159-1)
POOR, ANDRE P.; MORENO, LUISA Z.; MATAJIRA, CARLOS E. C.; PARRA, BEATRIZ M.; GOMES, VASCO T. M.; SILVA, ANA PAULA S.; DUTRA, MAURICIO C.; CHRIST, ANA PAULA G.; BARBOSA, MIKAELA R. F.; SATO, MARIA INES Z.; et al. Characterization of Corynebacterium diphtheriae, C. confusum and C-amycolatum isolated from sows with genitourinary infection. Veterinary Microbiology, v. 207, p. 149-152, . (15/26159-1, 15/26412-9, 13/17136-2, 13/16946-0)
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DE OLIVEIRA, MIRELA C. V.; CAMARGO, BEATRIZ Q.; CUNHA, MARCOS P. V.; SAIDENBERG, ANDRE BECKER; TEIXEIRA, RODRIGO H. F.; MATAJIRA, CARLOS E. C.; MORENO, LUISA Z.; GOMES, VASCO T. M.; CHRIST, ANA P. G.; BARBOSA, MIKAELA R. F.; et al. Free-Ranging Synanthropic Birds (Ardea alba and Columba livia domestica) as Carriers of Salmonella spp. and Diarrheagenic Escherichia coli in the Vicinity of an Urban Zoo. VECTOR-BORNE AND ZOONOTIC DISEASES, v. 18, n. 1, p. 65-69, . (14/11523-7, 15/26159-1, 16/12641-9)
MORENO, LUISA Z.; MATAJIRA, CARLOS E. C.; DA COSTA, BARBARA L. P.; FERREIRA, THAIS S. P.; SILVA, GIVAGO F. R.; DUTRA, MAURICIO C.; GOMES, VASCO T. M.; SILVA, ANA PAULA S.; CHRIST, ANA PAULA G.; SATO, MARIA INES Z.; et al. Characterization of porcine Trueperella pyogenes by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS), molecular typing and antimicrobial susceptibility profiling in Sao Paulo State. COMPARATIVE IMMUNOLOGY MICROBIOLOGY AND INFECTIOUS DISEASES, v. 51, p. 49-53, . (15/26159-1, 13/17136-2, 13/16946-0)
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POOR, ANDRE P.; MORENO, LUISA Z.; MONTEIRO, MATHEUS S.; MATAJIRA, CARLOS E. C.; DUTRA, MAURICIO C.; LEAL, DIEGO F.; SILVA, ANA PAULA S.; GOMES, VASCO T. M.; BARBOSA, MIKAELA R. F.; SATO, MARIA INES Z.; et al. Vaginal microbiota signatures in healthy and purulent vulvar discharge sows. SCIENTIFIC REPORTS, v. 12, n. 1, p. 12-pg., . (19/17683-0, 16/25745-7, 19/01192-7, 15/26159-1)
CABRERA MATAJIRA, CARLOS EMILIO; POOR, ANDRE PEGORARO; MORENO, LUISA ZANOLLI; MONTEIRO, MATHEUS SALIBA; DALMUTT, ANDRESSA CARINE; MOURA GOMES, VASCO TULIO; DUTRA, MAURICIO CABRAL; FUNADA BARBOSA, MIKAELA RENATA; ZANOLLI SATO, MARIA INES; MORENO, ANDREA MICKE. Vagococcus sp. a porcine pathogen: molecular and phenotypic characterization of strains isolated from diseased pigs in Brazil. JOURNAL OF INFECTION IN DEVELOPING COUNTRIES, v. 14, n. 11, p. 6-pg., . (17/09515-4, 15/26159-1)
MATAJIRA, CARLOS E. C.; MORENO, LUISA Z.; GOMES, VASCO T. M.; SILVA, ANA PAULA S.; MESQUITA, RENAN E.; AMIGO, CRISTINA R.; CHRIST, ANA PAULA G.; SATO, MARIA INES Z.; MORENO, ANDREA M.. Molecular and antimicrobial susceptibility characterization of Globicatella sulfidifaciens isolated from sow's urinary tract infection. VETERINARY QUARTERLY, v. 37, n. 1, p. 48-51, . (13/17136-2, 13/16946-0, 15/26159-1)
XAVIER OLIVEIRA, MARIA GABRIELA; NOGUEIRA PRESSINOTTI, LEANDRO; SPINOLA CARVALHO, GIOVANE; VILELA OLIVEIRA, MIRELA CAROLINE; MORENO, LUISA ZANOLLI; CABRERA MATAJIRA, CARLOS EMILIO; SPINOLA BERGAMO, ALESSANDRO; MANUEL ALEIXO, VICTOR; CAIXETA VEIGA, ALEXANDRE; DE SOUZA CORSINO, ELVIS; et al. Arcobacter spp. in fecal samples from Brazilian farmed caimans (Caiman yacare, Daudin 1802). TROPICAL ANIMAL HEALTH AND PRODUCTION, v. 49, n. 4, p. 777-782, . (13/17136-2, 14/07837-6, 14/06584-7, 15/26159-1)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
MATAJIRA, Carlos Emilio Cabrera. Análise comparativa de genomas de estirpes de Streptococcus suis isoladas de suínos no Brasil. 2020. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ/SBD) São Paulo.

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