Busca avançada
Ano de início
Entree

Metiloma e expressão alelo específica em bovinos Nelore extremos para eficiência alimentar

Processo: 15/17802-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de dezembro de 2015
Vigência (Término): 30 de abril de 2019
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Simone Cristina Méo Niciura
Beneficiário:Marina Ibelli Pereira Rocha
Instituição-sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):18/06785-3 - Perfil de metilação e análises de co-metilação em bovinos Nelore extremos para eficiência alimentar, BE.EP.DR
Assunto(s):Epigênese genética   Análise de sequência de RNA   Epigenômica   Consumo alimentar residual   Biologia molecular   Metilação

Resumo

Devido à grande importância da pecuária para a economia brasileira, muitos são os estudos baseados no melhoramento e na seleção precoce de animais superiores para características de interesse, como eficiência alimentar (EA) e, mais especificamente, consumo alimentar residual (CAR). Os recentes avanços no estudo do genoma, especialmente em métodos de sequenciamento de nova geração de DNA e RNA (RNA-seq), têm ajudado na compreensão dos mecanismos de regulação da expressão gênica e, consequentemente, da biologia dessas características. O estudo do epigenoma adiciona muitas informações à relação entre genótipo, ambiente e fenótipo. Diferenças na metilação entre alelos podem contribuir para a expressão diferencial e estudos demonstraram que a expressão alelo específica (EAE), está associada à metilação alelo específica (MAE). Além disso, a análise epigenética ampla é necessária para, juntamente com os dados de GWAS (genome wide association study), integrar os dados de SNPs e haplótipos com EAE e MAE. Assim, o presente projeto tem como objetivo analisar o perfil de EAE ao longo do transcriptoma, em fígado, e comparar esse perfil entre animais com fenótipos extremos para o CAR. Além disso, analisar o metiloma para identificação de regiões diferencialmente metiladas (RDM) entre os animais com fenótipos extremos. Os resultados obtidos serão integrados a dados prévios de GWAS e de genes diferencialmente expressos. A análise da metilação será realizada com o enriquecimento do DNA metilado por imunoprecipitação, tratamento com bissulfito de sódio e sequenciamento no HiSeq2000 (Illumina). Portanto, o desenvolvimento deste projeto irá adicionar novas camadas de informação aos resultados já obtidos permitindo maior enriquecendo das informações utilizadas para o melhoramento e seleção animal.

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (0 total):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)