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Capacidade de resiliência de comunidades microbianas avaliada por metagenômica e metatranscriptômica em solos de floresta e pastagem da Amazônia

Processo: 15/13546-7
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de outubro de 2015
Vigência (Término): 30 de junho de 2019
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Ciência do Solo
Pesquisador responsável:Tsai Siu Mui
Beneficiário:Andressa Monteiro Venturini
Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/50320-4 - Dimensões US-BIOTA - São Paulo: pesquisa colaborativa: integrando as dimensões da biodiversidade microbiana ao longo de áreas de alteração do uso da terra em florestas tropicais, AP.BTA.TEM
Bolsa(s) vinculada(s):17/09643-2 - Comunidades microbianas do solo na conversão floresta-pastagem: uma abordagem multi-ômica, BE.EP.DR
Assunto(s):Umidade do solo   Reação em cadeia da polimerase em tempo real   Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala   Microbiologia do solo   Ecologia microbiana
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:ciclo do metano | Ecologia microbiana | mudança de uso do solo | PCR quantitativo em tempo-real | Sequenciamento em larga escala | Umidade do solo | Microbiologia do Solo

Resumo

A Bacia Amazônica abriga as maiores florestas tropicais do planeta, que tem sido transformadas em áreas destinadas à agropecuária em decorrência do crescimento da demanda mundial por alimentos. A mudança de uso do solo altera as suas características físicas, químicas e biológicas originais. Consequentemente, os microrganismos do solo, que participam de processos essenciais para todos os ecossistemas terrestres, respondem de diferentes maneiras a essas mudanças, de forma a alterar a sua diversidade taxonômica e funcional. O uso antrópico do solo é considerado como uma das principais fontes emissoras dos gases do efeito estufa para a atmosfera e, assim, o estudo dos seus efeitos sobre os grupos microbianos que atuam dentro dos ciclos desses gases é de grande importância. Dentre esses, destaca-se o ciclo biogeoquímico do metano, considerado diretamente relacionado aos atributos da comunidade microbiana do solo. Diferentes fatores ambientais afetam os grupos de microrganismos produtores e consumidores de metano, com estudos que indicam a forte influência da umidade sobre os mesmos. Contudo, os efeitos da mudança do uso do solo e da umidade em solos sob diferentes usos sobre a diversidade microbiana taxonômica e funcional foram pouco explorados na literatura, especialmente em solos tropicais. Nesse contexto, o uso conjunto de técnicas moleculares a partir do DNA e RNA total do solo pode trazer novos dados a respeito desses impactos sobre a mesma. Portanto, o objetivo do projeto de pesquisa é determinar o efeito da mudança do uso do solo e da umidade em solos sob diferentes usos sobre a sua microbiota, com ênfase no ciclo do metano, pelo sequenciamento em larga escala e PCR quantitativo em tempo-real de amostras de DNA e RNA total de solo de áreas de floresta primária, floresta secundária e pastagem no Estado do Pará, na Amazônia Oriental.

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Publicações científicas (7)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MANDRO, JESSICA A.; NAKAMURA, FERNANDA M.; GONTIJO, JULIA B.; TSAI, SIU M.; VENTURINI, ANDRESSA M.. Metagenome-Assembled Genomes from Amazonian Soil Microbial Consortia. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 11, n. 11, p. 5-pg., . (14/50320-4, 15/12282-6, 15/23758-1, 15/13546-7, 19/26029-1, 18/14974-0, 19/25931-3)
GONTIJO, JULIA B.; PAULA, FABIANA S.; VENTURINI, ANDRESSA M.; YOSHIURA, CAIO A.; BORGES, CLOVIS D.; MOURA, JOSE MAURO S.; BOHANNAN, BRENDAN J. M.; NUSSLEIN, KLAUS; MAZZA RODRIGUES, JORGE L.; TSAI, SIU M.. Not just a methane source: Amazonian floodplain sediments harbour a high diversity of methanotrophs with different metabolic capabilities. Molecular Ecology, v. 30, n. 11, p. 2560-2572, . (14/50320-4, 17/26138-0, 18/14974-0, 17/09643-2, 15/13546-7, 19/25931-3)
ALVAREZ, DASIEL OBREGON; DE SOUZA, LEANDRO FONSECA; MENDES, LUCAS WILLIAM; DE MORAES, MOACIR TUZZIN; TOSI, MICAELA; VENTURINI, ANDRESSA MONTEIRO; MEYER, KYLE M.; DE CAMARGO, PLINIO BARBOSA; BOHANNAN, BRENDAN J. M.; MAZZA RODRIGUES, JORGE L.; et al. Shifts in functional traits and interactions patterns of soil methane-cycling communities following forest-to-pasture conversion in the Amazon Basin. Molecular Ecology, v. 32, n. 12, p. 19-pg., . (15/13546-7, 14/50320-4, 16/24695-6)
LEMOS, LEANDRO NASCIMENTO; MANOHARAN, LOKESHWARAN; MENDES, LUCAS WILLIAM; VENTURINI, ANDRESSA MONTEIRO; PYLRO, VICTOR SATLER; TSAI, SIU MUI. Metagenome assembled-genomes reveal similar functional profiles ofCPR/Patescibacteria phyla in soils. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS, v. 12, n. 6, p. 651-655, . (17/24037-1, 17/09643-2, 14/50320-4, 16/18215-1, 15/13546-7)
VENTURINI, ANDRESSA M.; DIAS, NAISSA M. S.; GONTIJO, JULIA B.; YOSHIURA, CAIO A.; PAULA, FABIANA S.; MEYER, KYLE M.; NAKAMURA, FERNANDA M.; DA FRANCA, ALINE G.; BORGES, CLOVIS D.; BARLOW, JOS; et al. Increased soil moisture intensifies the impacts of forest-to-pasture conversion on methane emissions and methane-cycling communities in the Eastern Amazon. Environmental Research, v. 212, p. 13-pg., . (14/50320-4, 15/13546-7, 15/08564-6, 19/25931-3, 17/09616-5, 17/26138-0, 15/19979-2, 16/11268-2, 17/09643-2, 17/09952-5, 15/12282-6, 18/14974-0)
VENTURINI, ANDRESSA MONTEIRO; NAKAMURA, FERNANDA MANCINI; GONTIJO, JULIA BRANDAO; DA FRANCA, ALINE GIOVANA; YOSHIURA, CAIO AUGUSTO; MANDRO, JESSICA ADRIELE; TSAI, SIU MUI. Robust DNA protocols for tropical soils. HELIYON, v. 6, n. 5, . (15/12282-6, 15/08564-6, 15/13546-7, 18/14974-0, 15/19979-2, 14/50320-4, 15/23758-1)
YOSHIURA, CAIO AUGUSTO; VENTURINI, ANDRESSA MONTEIRO; PEREZ BRAGA, LUCAS PALMA; DA FRANCA, ALINE GIOVANA; CATANHO PEREIRA DE LYRA, MARIA DO CARMO; TSAI, SIU MUI; RODRIGUES, JORGE LUIZ MAZZA. Responses of Low-Cost Input Combinations on the Microbial Structure of the Maize Rhizosphere for Greenhouse Gas Mitigation and Plant Biomass Production. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 12, . (13/22845-2, 15/19979-2, 15/13546-7, 15/08564-6, 16/11268-2, 14/50320-4, 19/25931-3)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
VENTURINI, Andressa Monteiro. Conversão floresta-pastagem na Amazônia Oriental: impactos sobre as comunidades microbianas do metano do solo. 2019. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA/STB) Piracicaba.

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