Identificação e caracterização de longos RNAs não-codificadores regulatórios no genoma de Schistosoma mansoni por meio de estratégias NGS e enfoque de sistemas

Resumo

Esquistossomas são vermes platelmintos trematódeos causadores de doenças infecto-parasitárias conhecidas como esquistossomoses. São hemoparasitas de ampla distribuição mundial e alta relevância em Saúde Pública e em estudos no campo da Parasitologia Molecular. O genoma de Schistosoma mansoni (agente etiológico no Brasil), que teve seu sequenciamento concluído em 2009, tem tamanho de 363 Mb e possui mais de onze mil genes. De posse destes dados estáticos, lança-se o desafio ainda maior de compreender a dinâmica de mecanismos moleculares responsáveis por características peculiares da biologia do parasita. Eventos pós-transcricionais de controle da expressão gênica, tais como modulação de splicing alternativo de mRNA e silenciamento por RNAi, assim como eventos epigenéticos tais como modificação de histonas, estão presentes em Schistosoma e, como nos demais eucariotos superiores, acredita-se que uma diversidade de RNAs não-codificadores (ncRNAs) regulatórios medeiam tais reações. Estratégias de sequenciamento de nova geração (NGS), como o RNA-Seq, vêm revelando a presença de uma ampla variedade de ncRNAs nos genomas de diversos organismos. Estes ensaios são capazes de gerar um amplo volume de dados propensos a análises computacionais que busquem revelar informações biológicas cruciais a respeito da expressão gênica e sua regulação. A presente proposta consiste na condução de experimentos in silico voltados para a avaliação completa do conteúdo do transcritoma não-codificador para proteínas escondido na grande quantidade de informação obtida por RNA-Seq em Schistosoma. Com isso, além da identificação/corroboração de novos elementos não-codificadores, com ênfase em longos ncRNAs (lncRNAs), a proposta tem como foco principal a associação destes com importantes vias de regulação gênica do parasita, possibilitando uma visão holística de sistemas que fusionará o conteúdo não-codificador com aquilo que é codificado em proteínas e suas respectivas vias regulatórias interligadas. (AU)