Análise da diversidade de bacteriófagos associada à comunidade microbiana durante o processo de compostagem

Resumo

Estudos metagenômicos têm caracterizado a estrutura e diversidade de comunidades microbianas em amostras ambientais. Os dados gerados trazem luz a organismos não-cultiváveis e têm ajudado a entender quem são os organismos participantes em processos complexos e inacessíveis até então. O projeto temático no qual esta proposta está inserida (processo 2011/50870-6) tem por objetivo caracterizar a diversidade de amostras ambientais de diferentes comunidades do Parque Zoológico do estado de SP, entre elas a comunidade associada ao processo de compostagem. Diversas análises foram realizadas no sentido de definir a diversidade de organismos celulares em dados metagenômicos da compostagem, porém a diversidade viral permanece intocada. Tendo em vista as perspectivas no campo da metagenômica viral, os resultados promissores produzidos por diferentes grupos e resultados preliminares gerados pela nossa equipe, este projeto tem por objetivo a caracterização da diversidade de bacteriófagos associada à comunidade microbiana ao longo do processo de compostagem. Para tal, realizaremos um data mining exaustivo dos dados metagenômicos gerados. Além disso, iremos analisar fagos isolados da compostagem através do co-cultivo com Pseudomonas aeruginosa e outras espécies. Resultados preliminares do sequenciamento destes fagos indicam uma grande quantidade de sequências desconhecidas. Ambas as abordagens gerarão dados que serão anotados e armazenados em um banco de dados. Esperamos, assim, obter genomas parciais e/ou completos de novos fagos associados à comunidade termofílica do processo de compostagem. (AU)