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Usando métodos comparativos filogenômicos para entender a diversificação dos peixes da superfamília Loricarioidea

Processo: 14/05051-5
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de novembro de 2014
Vigência (Término): 31 de agosto de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Pesquisador responsável:Claudio de Oliveira
Beneficiário:Fábio Fernandes Roxo
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):15/00691-9 - Usando métodos comparativos filogenômicos para entender a diversificação dos peixes da superfamília Loricarioidea, BE.EP.PD
Assunto(s):DNA   Evolução animal   Sistemática   Siluriformes
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Dna | Evolução | genética | siluriformes | Sistematica | Uce | Sistemática Molecular

Resumo

Loricarioidea é o maior grupo monofilético dos catfishes endêmico aos Neotrópicos com mais de 1.412 nomes válidos incluídos em seis táxons em nível de família: Astroblepidae (61 espécies), Callichthyidae (200 espécies), Loricariidae (870 espécies), Nematogenyidae (1 espécies), Scoloplacidae (6 espécies) e Trichomycteridae (273 espécies). Os peixes Loricarioidea são amplamente distribuídos através dos habitats de água doce nas regiões tropicais da América do Sul e sudeste da América Central. Em comparação a excepcional riqueza de espécies, os Loricarioidea exibem uma ampla gama de especializações morfológicas, fisiológicas e ecológicas, ocupando muitos dos habitats e níveis tróficos, incluindo herbívoros, parasitas (Vandelia) e o único peixe comedor de madeira conhecido (Panaque). As morfologias, da boca em formato de disco e os dentes em formato de colher, permitem muitas espécies forragear algas e subir pela superfície dos substratos, e os Astroblepides também tem a habilidade de subir cachoeiras. As grandes diversidades dos peixes Loricarioidea proporcionam um material abundante para estudos de questões fundamentais em evolução e ecologia. Quais fatores intrínsecos dos organismos e externos ao ambiente promovem ou restringem a diversificação dentro do clado Loricarioidea? Por que alguns clados tem tamanha riqueza de espécies (como Loricariidae com 870 espécies) enquanto outros clados tem uma diversidade tão baixa (como Nematogenyidae com 1 espécies, ou Scoloplacidae com 6 espécies)? Como pode uma dúzia ou mais de espécies de uma única subfamília, todas com aparentemente necessidades ecológicas equivalentes em termos de habitats e fontes alimentares, coexistirem simpatricamente dentro de um sistema de rios? Assim, nós propomos combinar os recursos intelectuais e genéticos nos EU e Brasil para reconstruir a filogenia de Loricarioidea, com a maior densidade de táxons amostrados desse grupo com a finalidade de estudar as dinâmicas de diversificação e entender a distribuição de espécies e ecossistemas, à luz dos processos históricos que moldaram a evolução da paisagem da Terra. (AU)

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Publicações científicas (36)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ROXO, FABIO F.; SILVA, GABRIEL S. C.; OLIVEIRA, CLAUDIO. Description of a new species of Parotocinclus (Siluriformes, Hypoptopomatinae) from the rio Tapajos basin. ZOOKEYS, n. 634, p. 125-136, . (12/01622-2, 15/00691-9, 14/05051-5)
ROXO, FABIO F.; SILVA, GABRIEL S. C.; OCHOA, LUZ E.; OLIVEIRA, CLAUDIO. Description of a new genus and three new species of Otothyrinae (Siluriformes, Loricariidae). ZOOKEYS, n. 534, p. 103-134, . (12/01622-2, 14/06853-8, 14/05051-5)
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ROXO, FABIO F.; SILVA, GABRIEL S. C.; OLIVEIRA, CLAUDIO. A new species of Hisonotus (Siluriformes, Loricariidae) from rio Sao Francisco basin, Brazil. ZOOKEYS, n. 498, p. 127-143, . (12/01622-2, 14/05051-5)
FAIRCLOTH, BRANT C.; ALDA, FERNANDO; HOEKZEMA, KENDRA; BURNS, MICHAEL D.; OLIVEIRA, CLAUDIO; ALBERT, JAMES S.; MELO, BRUNO F.; OCHOA, LUZ E.; ROXO, FABIO F.; CHAKRABARTY, PROSANTA; et al. A Target Enrichment Bait Set for Studying Relationships among Ostariophysan Fishes. Copeia, v. 108, n. 1, p. 47-60, . (16/11313-8, 14/26508-3, 14/06853-8, 14/05051-5)
OCHOA, LUZ E.; DATOVO, ALESSIO; DONASCIMIENTO, CARLOS; ROXO, FABIO F.; SABAJ, MARK H.; CHANG, JONATHAN; MELO, BRUNO F.; SILVA, GABRIEL S. C.; FORESTI, FAUSTO; ALFARO, MICHAEL; et al. Phylogenomic analysis of trichomycterid catfishes (Teleostei: Siluriformes) inferred from ultraconserved elements. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, . (15/13382-4, 14/06853-8, 14/26508-3, 16/11313-8, 15/00691-9, 16/19075-9, 14/05051-5)
MATEUSSI, NADAYCA T. B.; MELO, BRUNO F.; OTA, RAFAELA P.; ROXO, FABIO F.; OCHOA, LUZ E.; FORESTI, FAUSTO; OLIVEIRA, CLAUDIO. Phylogenomics of the Neotropical fish family Serrasalmidae with a novel intrafamilial classification (Teleostei: Characiformes). Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 153, . (15/00691-9, 14/06853-8, 18/23883-9, 18/24040-5, 16/11313-8, 16/09204-6, 18/20610-1, 14/05051-5, 14/26508-3)
DIAS, ANGELICA C.; SILVA, GABRIEL S. C.; OLIVEIRA, CLAUDIO; ROXO, FABIO F.. A new species of Hisonotus (Siluriformes: Loricariidae) from Aripuana river, Amazon basin, Brazil. Zootaxa, v. 4504, n. 4, p. 577-585, . (14/05051-5)
SILVA, GABRIEL S. C.; COVAIN, RAPHAEL; OLIVEIRA, CLAUDIO; ROXO, FABIO F.. Description of two new species of Lithoxus (Hypostominae: Loricariidae) from rio Jari and rio Amapa basins, Brazilian Guiana Shield. Zootaxa, v. 4347, n. 1, p. 151-168, . (15/00691-9, 14/05051-5)
SILVA, GABRIEL S. C.; ROXO, FABIO F.; OYAKAWA, OSVALDO T.. Description of a new species of Pareiorhina (Siluriformes: Loricariidae) from the rio Sao Francisco basin, Brazil. Zootaxa, v. 4107, n. 3, p. 381-391, . (12/01622-2, 15/00691-9, 14/05051-5)
ROXO, FABIO F.; SILVA, GABRIEL S. C.; WALTZ, BRANDON T.; MELO, JORGE E. G.. A new species of Hisonotus (Siluriformes: Otothyrinae) from the upper rio Parana and rio Sao Francisco basins, Brazil. Zootaxa, v. 4109, n. 2, p. 227-238, . (12/01622-2, 14/05051-5)
ZAWADZKI, CLAUDIO H.; ROXO, FABIO F.; DA GRACA, WEFERSON J.. Hisonotus pachysarkos, a new species of cascudinho from the rio Ivai basin, upper rio Parana system, Brazil (Loricariidae: Otothyrinae). Ichthyological Exploration of Freshwaters, v. 26, n. 4, p. 373-383, . (15/00691-9, 14/05051-5)
ROXO, FABIO F.; SILVA, GABRIEL S. C.; OCHOA, LUZ ENEIDA; ZAWADZKI, CLAUDIO H.. Description of a new species of Gymnotocinclus from the rio Tocantins basin with phylogenetic analysis of the subfamily Hypoptopomatinae (Siluriformes: Loricariidae). Zootaxa, v. 4268, n. 3, p. 337-359, . (12/01622-2, 14/05051-5)
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ROXO, FABIO F.; SILVA, GABRIEL S. C.; OLIVEIRA, CLAUDIO. A new species of Hisonotus (Siluriformes, Loricariidae) from rio Sao Francisco basin, Brazil. ZOOKEYS, v. N/A, n. 498, p. 17-pg., . (14/05051-5, 12/01622-2)
ROXO, FABIO F.; SILVA, GABRIEL S. C.; OLIVEIRA, CLAUDIO. Description of a new species of Parotocinclus (Siluriformes, Hypoptopomatinae) from the rio Tapajos basin. ZOOKEYS, v. N/A, n. 634, p. 12-pg., . (15/00691-9, 14/05051-5, 12/01622-2)
OCHOA, LUZ E.; ROXO, FABIO F.; DONASCIMIENTO, CARLOS; SABAJ, MARK H.; DATOVO, ALESSI; ALFARO, MICHAEL; OLIVEIRA, CLAUDIO. Multilocus analysis of the catfish family Trichomycteridae (Teleostei: Ostariophysi: Siluriformes) supporting a monophyletic Trichomycterinae. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 115, p. 71-81, . (15/13382-4, 14/06853-8, 14/26508-3, 15/00691-9, 10/17009-2, 14/05051-5)
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ROXO, FABIO F.; OCHOA, LUZ E.; SABAJ, MARK H.; LUJAN, NATHAN K.; COVAIN, RAPHAEL; SILVA, GABRIEL S. C.; MELO, BRUNO F.; ALBERT, JAMES S.; CHANG, JONATHAN; FORESTI, FAUSTO; et al. Phylogenomic reappraisal of the Neotropical catfish family Loricariidae (Teleostei: Siluriformes) using ultraconserved elements. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 135, p. 148-165, . (12/01622-2, 14/06853-8, 14/26508-3, 16/11313-8, 15/00691-9, 14/05051-5)
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