Identificação de redes de genes e genoma ativo de cana-de-açúcar associados à seca

Resumo

A importância ambiental e econômica da cana-de-açúcar vem crescendo, sendo o Brasil, atualmente, o maior produtor de cana e também de açúcar e etanol. Para o crescimento do mercado sucroalcooleiro é prevista a expansão das áreas de cultivo de cana-de-açúcar para regiões que apresentam condições menos adequadas ao plantio, como é o caso das regiões Centro-Oeste e Nordeste do Brasil. Assim, é importante o desenvolvimento de plantas que apresentem tolerância a condições de estresses como a seca, bem como aliar essa característica à alta produtividade em etanol. O laboratório está conduzindo o sequenciamento do genoma da cana e para o melhoramento genético dessa gramínea é necessário ainda caracterizar funcionalmente os genes identificados e compreender a regulação da expressão gênica e as funções relacionadas a características agronômicas de interesse. Nesse contexto, desvendar as complexas redes regulatórias de cana-de-açúcar é um caminho para a obtenção de informações das vias de regulação e possíveis consequências de sua alteração. A técnica de ChIP-Seq tem sido utilizada no estudo das interações DNA-proteínas e apresenta grande aplicabilidade no estudo das redes de regulação transcricional. O presente projeto visa obter um conjunto de sequências genômicas enriquecidas em um precipitado de DNA ligado à RNA polimerase II em paralelo à definição de um conjunto de genes regulados pelo estresse hídrico. A longo prazo, o projeto objetiva gerar ferramentas que permitam à comunidade associar tratos agronômicos de interesse a motivos regulatórios.