Detecção genômica de alelos letais recessivos pela ausência ou baixa frequência de haplótipos homozigotos em gado zebu

Resumo

Tendo em vista os avanços das pesquisas pecuárias brasileira e sabendo que a fertilidade é uma característica importante e complexa para ser melhorado, este projeto tem como objetivo detectar genes possivelmente relacionados a morte embrionária, que é um importante indicador de fertilidade. Tradicionalmente, a abordagem para detectar morte embrionária era acompanhar o desenvolvimento do embrião e registrar os abortos, natimortos e quaisquer outras perdas. O custo de produção pecuária aumenta drasticamente quando a fertilidade declina devido à necessidade de se repetir a inseminação ou a monta natural. No entanto, com a disponibilidade dos chips de marcadores do tipo SNP abordagens diferentes têm sido propostas como meios alternativos de detecção destes haplótipos letais. Estas novas formas de identificar os haplótipos no genoma têm sido utilizados por VanRaden et al (2011), Sonstegard et al (2013) e Fritz et. al (2013) para encontrar haplótipos letais presente em raças de gado leiteiro. Para afirmar que esses haplótipos identificados foram de fato responsáveis pela mortalidade embrionária; Sontegard et al. (2013) realizou um estudo utilizando dados de sequênciamento após a identificação da região haplotípica. A abordagem proposta por Vanraden et al (2011) foi procurar e identificar, pelo genoma, haplótipos que nunca estão presentes ou estão em freqüência muito baixa em seu estado homozigoto, embora fossem esperadas altas frequências para estes, devido ao uso excessivo de antepassados que transportavam estes haplótipos. Em suma, a abordagem é identificar haplótipos que nunca são observados em seu estado homozigoto embora os touros ou antepassados que os transportavam terem sido usados para produzir centenas de milhares de descendentes. Portanto, este estudo tem como objetivo identificar esses haplótipos letais em duas raças zebuína (Gir e Guzerá) para doenças genéticas que até então não foram observadas, também será o primeiro tipo de estudo a ser realizado em gado Bos indicus. (AU)