Caracterização funcional de RNAs não-codificantes associados a transposons IS1341 em Halobacterium salinarum

Resumo

Os elementos genéticos móveis (Mobile Genetic Elements MGEs), são elementos extremamente importantes para plasticidade e evolução dos genomas. Seus impactos são diversos, podendo conferir resistência microbiana a antibióticos como estarem relacionados a doenças em humanos. Uma das classes mais importantes de MGEs são as sequências de inserção (insertion sequences - IS). Estes elementos são encontrados em bactérias e archaea e apresentam grande diversidade de famílias e mecanismos de movimentação. Uma família interessante de IS é a IS200/605, esta família encontra-se distribuída em bactérias, archaea e vírus e é dividida em 3 subgrupos: IS200, IS605 e IS1341. Outro aspecto interessante é a utilização de substratos de DNA de fita simples para seu processo de transposição. Em estudo recente de Gomes-Filho et al., 2015, foi demonstrada a presença de RNAs sobrepostos ao 3' de genes IS1341 em archaea e bactérias, os sense overlapping transcripts (sotRNAs). Estes RNAs apresentam um motivo chamado de UUCA tetraloop, que também foi encontrado em um ncRNA intergênico. A superexpressão de RNAs contendo este motivo, resultou em melhor crescimento de H. salinarum NRC-1. Deste modo, para dar continuidade aos trabalhos iniciados em Gomes-Filho et al, 2015, realizaremos experimentos focados na caracterização fenotípica das linhagens de superexpressão, como curvas de crescimento, ensaios de sobrevivência e adesão. A partir dos resultados encontrados, direcionaremos técnicas moleculares, como RNAseq, para elucidar potenciais alvos de regulação destes RNAs, podendo assim adicioná-los às redes de regulação gênica já construídas para H. salinarum NRC-1. (AU)