Identificação da metilação do DNA regulando a expressão diferencial de genes homeólogos em Coffea arabica

Resumo

O café é uma das commodities agrícolas mais importantes no mundo. Este tem sido alvo nos programas de melhoramento genético visando a introdução de novos caracteres para obtenção de híbridos com características agronômicas superiores, como floração uniforme, maior rendimento, maior tamanho do grão, melhor qualidade da bebida, menor teor de cafeína e resistência a estresses bióticos e abióticos. Por ser um alotetraplóide, o genoma de Coffea arabica é a fusão dos genomas de seus ancestrais diplóides, Coffea canephora e Coffea eugenioides, que passaram a ser subgenomas nessa espécie. Dessa forma, os transcritos expressos por C. arabica são uma combinação de genes homeólogos desses dois subgenomas; sendo que a regulação destes genes modula a expressão nos tecidos e condições biológicas diferentes, o que poderia explicar a maior plasticidade ambiental de C. arabica e de outros alopoliplóides. No entanto, o estudo dos mecanismos que regulam tal processo é um dos grandes desafios atualmente. Este projeto consiste na identificação de marcas de metilação de DNA em genes homeólogos em C. arabica e sua correlação com os níveis de transcrição desses genes, a fim de caracterizar possíveis mecanismos de regulação de expressão gênica. Será feita a avaliação da expressão dos homeólogos em diferentes tecidos (folhas, inflorescências, frutos e raízes) e estádios de desenvolvimento, traçando os perfis de metilação relacionados a estes. Consideramos este projeto importante para a elucidação da regulação da expressão dos genes homeólogos em C. arabica, dando suporte a estratégias alternativas para o melhoramento e seleção guiada.