Bolsa 13/07159-5 - Proteínas de ligação a RNA, Glioblastoma - BV FAPESP
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Proteínas de ligação a RNA e variações pós-transcricionais: influência no desenvolvimento de glioblastomas multiformes

Processo: 13/07159-5
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de julho de 2013
Data de Término da vigência: 31 de março de 2017
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Pedro Alexandre Favoretto Galante
Beneficiário:Bruna Renata Silva Corrêa
Instituição Sede: Hospital Sírio-Libanês. Sociedade Beneficente de Senhoras (SBSHSL). São Paulo , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):13/25483-4 - Identificação e análise funcional de proteínas de ligação a RNA associadas com o desenvolvimento do glioblastoma multiforme, BE.EP.DR
Assunto(s):Proteínas de ligação a RNA   Glioblastoma   Biologia computacional   Processamento alternativo   Poliadenilação   Análise de sequência de RNA
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:bioinformática | Gbm | poliadenilação alternativa | Proteínas de ligação a RNA | RNA-seq | Splicing alternativo | Bioinformática

Resumo

O glioblastoma multiforme (GBM) é considerado um dos tumores mais graves e agressivos. A sobrevida média dos afetados é de apenas 15 meses após o diagnóstico. Além disso, os tratamentos atuais, com radioterapia, quimioterapia e cirurgias, não são capazes de impedir a recidiva do tumor na maioria dos casos, devido, em parte, à contribuição direta de uma subpopulação celular tumoral de GBM com características de células-tronco. Assim, é fundamental ampliar a compreensão a respeito de aspectos básicos da biologia desse tipo tumoral, como sua origem, desenvolvimento e mecanismos de resistência, em especial os relacionados a essa subpopulação celular, para que seja possível a elaboração de novas terapias mais eficazes. Entre as moléculas que podem ter um papel importante no desenvolvimento do GBM, as proteínas de ligação a RNA (RBPs) merecem destaque. As RBPs compreendem uma classe de reguladores pós-transcricionais da expressão gênica, com papel fundamental em todos os eventos que conectam transcrição e tradução, tais como splicing, poliadenilação, estabilidade, degradação e transporte de RNAs. Portanto, alterações nos níveis destas proteínas podem causar severas modificações nos eventos de processamento pós-transcricionais de RNAs e, como consequência, impactar o funcionamento normal de diversas células e provocar o desenvolvimento de estados patológicos, entre os quais está o câncer. No presente trabalho, sequenciaremos o transcriptoma de células-tronco de GBM e células-tronco neuronais, as quais são usadas como modelos de desenvolvimento e resistência tumoral, e utilizaremos ferramentas de bioinformática e validação experimental para identificar e estudar as variações de expressão gênica das RBPs e sua influência nos eventos de splicing e poliadenilação alternativa. Com isso, pretendemos ampliar o conhecimento a respeito da influência das RBPs e dos eventos pós-transcricionais no desenvolvimento e resistência do GBM. (AU)

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Publicações científicas (8)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GUARDIA, GABRIELA D. A.; CORREA, BRUNA R.; ARAUJO, PATRICIA ROSA; QIAO, MEI; BURNS, SUZANNE; PENALVA, LUIZ O. F.; GALANTE, PEDRO A. F.. Proneural and mesenchymal glioma stem cells display major differences in splicing and lncRNA profiles. NPJ GENOMIC MEDICINE, v. 5, n. 1, . (18/15579-8, 13/07159-5, 17/19541-2, 13/25483-4)
CORREA, BRUNA R. S.; HU, JOANNA; PENALVA, LUIZ O. F.; SCHLEGEL, RICHARD; RIMM, DAVID L.; GALANTE, PEDRO A. F.; AGARWAL, SEEMA. Patient-derived conditionally reprogrammed cells maintain intra-tumor genetic heterogeneity. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, . (13/07159-5, 13/25483-4)
VELASCO, MITZLI X.; KOSTI, ADAM; GUARDIA, GABRIELA D. A.; SANTOS, MARCIA C.; TEGGE, ALLISON; QIAO, MEI; CORREA, BRUNA R. S.; HERNANDEZ, GRECO; KOKOVAY, ERZSEBET; GALANTE, PEDRO A. F.; et al. Antagonism between the RNA-binding protein Musashi1 and miR-137 and its potential impact on neurogenesis and glioblastoma development. RNA, v. 25, n. 7, p. 768-782, . (13/07159-5, 17/19541-2, 13/25483-4)
BETTONI, FABIANA; MASOTTI, CIBELE; CORREA, BRUNA R.; DONNARD, ELISA; DOS SANTOS, FILIPE F.; SAO JULIAO, GUILHERME P.; VAILATI, BRUNA B.; HABR-GAMA, ANGELITA; GALANTE, PEDRO A. F.; PEREZ, RODRIGO O.; et al. The Effects of Neoadjuvant Chemoradiation in Locally Advanced Rectal Cancer-The Impact in Intratumoral Heterogeneity. FRONTIERS IN ONCOLOGY, v. 9, . (13/07159-5, 15/17208-9, 11/51130-6, 10/12658-2)
CORREA, BRUNA R.; DE ARAUJO, PATRICIA ROSA; QIAO, MEI; BURNS, SUZANNE C.; CHEN, CHEN; SCHLEGEL, RICHARD; AGARWAL, SEEMA; GALANTE, PEDRO A. F.; PENALVA, LUIZ O. F.. Functional genomics analyses of RNA-binding proteins reveal the splicing regulator SNRPB as an oncogenic candidate in glioblastoma. GENOME BIOLOGY, v. 17, p. 16-pg., . (13/25483-4, 13/07159-5)
CORREA, BRUNA R.; DE ARAUJO, PATRICIA ROSA; QIAO, MEI; BURNS, SUZANNE C.; CHEN, CHEN; SCHLEGEL, RICHARD; AGARWAL, SEEMA; GALANTE, PEDRO A. F.; PENALVA, LUIZ O. F.. Functional genomics analyses of RNA-binding proteins reveal the splicing regulator SNRPB as an oncogenic candidate in glioblastoma. Genome Biology, v. 17, . (13/07159-5, 13/25483-4)
CAMBULI, F. M.; CORREA, B. R.; REZZA, A.; BURNS, S. C.; QIAO, M.; UREN, P. J.; KRESS, E.; BOUSSOUAR, A.; GALANTE, P. A. F.; PENALVA, L. O. F.; et al. A Mouse Model of Targeted Musashi1 Expression in Whole Intestinal Epithelium Suggests Regulatory Roles in Cell Cycle and Stemness. Stem Cells, v. 33, n. 12, SI, p. 3621-3634, . (13/07159-5)
CAMBULI, F. M.; CORREA, B. R.; REZZA, A.; BURNS, S. C.; QIAO, M.; UREN, P. J.; KRESS, E.; BOUSSOUAR, A.; GALANTE, P. A. F.; PENALVA, L. O. F.; et al. A Mouse Model of Targeted Musashi1 Expression in Whole Intestinal Epithelium Suggests Regulatory Roles in Cell Cycle and Stemness. Stem Cells, v. 33, n. 12, p. 14-pg., . (13/07159-5)

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