Mapeamento físico de sequências repetitivas de DNA no genoma de espécies do gênero Trichomycterus (Siluriformes, Trichomycteridae)

Resumo

O estudo dos peixes Neotropicais tem-se expandido consideravelmente nos últimos anos, principalmente devido à incorporação de novas técnicas de obtenção e interpretação de dados. No entanto, o relacionamento entre muitos grupos necessita ainda de um melhor esclarecimento e a aplicação das técnicas de bandamento cromossômico, o emprego de fluorocromos base específicos, o uso da metodologia de análise filogenética e a hibridação in situ com sondas fluorescentes tem sido responsável por parte da expansão do conhecimento e compreensão dos processos evolutivos em peixes Neotropicais. Nesse sentido, o desenvolvimento de sondas específicas como as de genes ribossômicos e de histonas, constituídas por DNA de moderada repetitividade, as de DNA altamente repetitivo (DNA satélite) e o advento da microdissecção cromossômica (método que possibilita o isolamento direto de DNA de qualquer região citogeneticamente reconhecida), tem possibilitado a hibridização destes marcadores em cromossomos metafásicos através de técnica denominada FISH, permitindo o mapeamento destes genes nos cromossomos e ampliando as perspectivas de análise e estudo nesse grupo de vertebrados. O presente projeto se insere no programa geral de estudos de citogenética e genética molecular de peixes Neotropicais em desenvolvimento no Laboratório de Biologia e Genética de Peixes (IBB/UNESP/BOTUCATU) e tem por objetivo principal a análise citogenética em nível estrutural e molecular de espécies e populações de peixes do gênero Trichomycterus que ocorrem em diferentes bacias hidrográficas (T. iherengi - rio Tietê; T. diabolus - rio Paranapanema; T. zonatus - bacia Costeira do Sudeste e T. cf. mimonha - bacia do rio Grande). O trabalho se baseará na análise citogenética convencional (Giemsa, RONs, Bandamento C) e molecular, com amplo mapeamento físico de sequências de DNA, envolvendo a aplicação dos fluorocromos bases específicos CMA3 e DAPI, a localização dos genes de DNAr 18S e 5S, de sequências teloméricas (TTAGGG)n, a localização de clusters para a proteína Histona H1, H3 e H4 e a localização dos elementos retrotransponíveis Rex1, Rex3 e Rex6. O desenvolvimento do presente projeto contribuirá com informações para a identificação dos mecanismos ligados ao processo de diversificação cromossômica dentro do gênero Trichomycterus, para o conhecimento da estrutura cromossômica e organização de algumas sequências de DNA no genoma dos peixes e ainda contribuirá com informações que auxiliem no estabelecimento das possíveis relações filogenéticas e evolutivas entre as espécies e populações analisadas. (AU)